RNA–Protein interactions for RNA: YMR111C

YMR111C, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YMR111C, Length 1,389 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR111C	YMR111C	CSG2	P35206	410 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	SPT8	P38915	602 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	SMF1	P38925	575 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	KHA1	P40309	873 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	MET12	P46151	657 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	TAH11	P47112	604 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	COS5	P47187	383 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	MRPL19	P53875	158 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	KTR6	P54070	446 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	TPO1	Q07824	586 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	GRC3	Q07845	632 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	THI20	Q08224	551 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	HSP42	Q12329	375 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	BIK1	P11709	440 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	MRPL8	P22353	238 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	DAL2	P25335	343 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	PRE4	P30657	266 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	KAR9	P32526	644 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	STE14	P32584	239 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	NPL6	P32832	435 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	CNS1	P33313	385 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	RKM3	P38222	552 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	YBR138C	P38277	524 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	IFA38	P38286	347 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	CCT6	P39079	546 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	TIM17	P39515	158 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	YAL037W	P39728	267 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	YEL075C	P39972	122 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	SNG1	P46950	547 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	IKS1	P47042	667 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	TEL2	P53038	688 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	ATG21	Q02887	496 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	YDR132C	Q03900	495 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	ZRT2	Q12436	422 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	URA3	P03962	267 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	OM45	P16547	393 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	SPR1	P32603	445 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	MTC7	P32633	139 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	PRM9	P39551	298 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	CAB2	P40506	365 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	ZIM17	P42844	174 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	BIT61	P47041	543 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	TCB2	P48231	1178 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	HOP2	P53187	214 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	COX18	P53239	316 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	BSC5	P53755	489 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	ARG7	Q04728	441 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	YPR114W	Q06107	315 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	EMP46	Q12396	444 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	MET8	P15807	274 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	SEC62	P21825	274 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	ARG1	P22768	420 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	YCR006C	P25350	157 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	NTH1	P32356	751 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	SRB2	P34162	210 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	SET3	P36124	751 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	YHR112C	P38716	378 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	PAN6	P40459	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	DJP1	P40564	432 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	PEX31	P53203	462 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	YAP1802	P53309	568 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	IPI3	P53877	555 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	TAF11	Q04226	346 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	YKU80	Q04437	629 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	VPS36	Q06696	566 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	VPS68	Q12016	184 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	AIM41	Q12032	185 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	YDR262W	Q12331	272 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	CTS1	P29029	562 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	PXL1	P36166	706 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	MTG2	P38860	518 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	RIP-Chip
YMR111C	YMR111C	CHA4	P43634	648 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	PEX25	Q02969	394 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR111C	YMR111C	RCF1	Q03713	159 aa		4.59	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 75.7 ms