RNA–Protein interactions for RNA: YGR215W

RSM27, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene RSM27, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RSM27	YGR215W	YOR365C	Q08844	703 aa		3.61	□□□□□ -1.83
RSM27	YGR215W	CTI6	Q08923	506 aa		3.61	□□□□□ -1.83
RSM27	YGR215W	GAL80	P04387	435 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RSM27	YGR215W	YME1	P32795	747 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RSM27	YGR215W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
RSM27	YGR215W	SRO77	P38163	1010 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RSM27	YGR215W	YJL213W	P40896	331 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RSM27	YGR215W	TOF2	Q02208	771 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RSM27	YGR215W	RPM2	Q02773	1202 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RSM27	YGR215W	SLD5	Q03406	294 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RSM27	YGR215W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
RSM27	YGR215W	VPS38	Q05919	439 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RSM27	YGR215W	SYO1	Q07395	620 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RSM27	YGR215W	AYT1	Q12226	474 aa		3.6	□□□□□ -1.83
RSM27	YGR215W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
RSM27	YGR215W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
RSM27	YGR215W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
RSM27	YGR215W	ELO2	P25358	347 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RSM27	YGR215W	YCR022C	P25620	114 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RSM27	YGR215W	SPC110	P32380	944 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RSM27	YGR215W	SHP1	P34223	423 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RSM27	YGR215W	BNA4	P38169	460 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RSM27	YGR215W	MSR1	P38714	643 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RSM27	YGR215W	YHR218W	P38899	603 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RSM27	YGR215W	NPR2	P39923	615 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RSM27	YGR215W	AIM22	P47051	409 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RSM27	YGR215W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
RSM27	YGR215W	PHO92	Q06390	306 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RSM27	YGR215W	YDL009C	Q12210	107 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RSM27	YGR215W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RSM27	YGR215W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	YDL186W	P48568	277 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	YDL121C	Q07541	149 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	MSN2	P33748	704 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	SHO1	P40073	367 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	YGR066C	P53242	292 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	VPS75	P53853	264 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	AVL9	Q12500	764 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	SUC2	P00724	532 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	HEM2	P05373	342 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	COR1	P07256	457 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	MET8	P15807	274 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	CPR3	P25719	182 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	UTR4	P32626	227 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	PET130	P47065	347 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	WSC2	P53832	503 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	IRC15	Q02733	499 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	BNA5	Q05979	453 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	GCN4	P03069	281 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	YCR007C	P25354	239 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	DUG2	P38149	878 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	YBR225W	P38321	900 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	RMD8	P43620	662 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	COS10	P52924	374 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	GPI1	P53306	609 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	TIM10	P87108	93 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	YDR239C	Q03780	787 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	MFB1	Q04922	465 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	RAV1	P47104	1357 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	FOB1	O13329	566 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	PMU1	P36069	295 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	TUL1	P36096	758 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	MBB1	P39534	108 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	RKM5	Q12367	367 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	PRD1	P25375	712 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	CST26	P38226	397 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	PCA1	P38360	1216 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	ALG8	P40351	577 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	ELP2	P42935	788 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	FIN1	Q03898	291 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
RSM27	YGR215W	YML133C	Q03099	1374 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RSM27	YGR215W	YLL067C	Q07888	1374 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RSM27	YGR215W	YLL066C	Q99208	1374 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RSM27	YGR215W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.52	□□□□□ -1.85	not detected
RSM27	YGR215W	EXO70	P19658	623 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RSM27	YGR215W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
RSM27	YGR215W	YEL057C	P39983	233 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RSM27	YGR215W	HAT2	P39984	401 aa		3.52	□□□□□ -1.85

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