RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487320.5

CLHC1-212, Transcript of clathrin heavy chain linker domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene CLHC1, Length 594 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLHC1-212ENST00000487320 KIF18BQ86Y91 864 aa6.12□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 SMC5Q8IY18 1101 aa6.12□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 CHPFQ8IZ52 775 aa6.12□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 MYO1HQ8N1T3 1032 aa6.12□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 CNTD1Q8N815 330 aa6.12□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 KREMEN2Q8NCW0 462 aa6.12□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 CFAP43Q8NDM7 1665 aa6.12□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 OR2W6PQ8NHA6 318 aa6.12□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6.12□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 USP7Q93009 1102 aa6.12□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 HOOK2Q96ED9 719 aa6.12□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 SLC39A13Q96H72 371 aa6.12□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.12□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 MIPEPQ99797 713 aa6.12□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.12□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.12□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.12□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.12□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa6.11□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 EFCAB5A4FU69 1503 aa6.11□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 K7ESF4 209 aa6.11□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 AQP7O14520 342 aa6.11□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 CAND2O75155 1236 aa6.11□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 CRTAMO95727 393 aa6.11□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 ETV3P41162 512 aa6.11□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 ID4P47928 161 aa6.11□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 PPP2R5DQ14738 602 aa6.11□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 TESK1Q15569 626 aa6.11□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 TRAPPC3LQ5T215 181 aa6.11□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 SYDE2Q5VT97 1194 aa6.11□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6.11□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 USP53Q70EK8 1073 aa6.11□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 C14orf80Q86SX3 495 aa6.11□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 CDH24Q86UP0 819 aa6.11□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 TTC8Q8TAM2 541 aa6.11□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 COG1Q8WTW3 980 aa6.11□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 DCAF4Q8WV16 495 aa6.11□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.11□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 PLVAPQ9BX97 442 aa6.11□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 FBXL21Q9UKT6 434 aa6.11□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 SPEF1Q9Y4P9 236 aa6.11□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 KIF21BO75037 1637 aa6.1□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 PLCH2O75038 1416 aa6.1□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 CBX4O00257 560 aa6.1□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 ABLIM3O94929 683 aa6.1□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 GATA4P43694 442 aa6.1□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 KCNJ6P48051 423 aa6.1□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 AMPD2Q01433 879 aa6.1□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 DSG1Q02413 1049 aa6.1□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.1□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 FAM102BQ5T8I3 360 aa6.1□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 PIK3R6Q5UE93 754 aa6.1□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.1□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 ZBTB46Q86UZ6 589 aa6.1□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 PASD1Q8IV76 773 aa6.1□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 TCEAL8Q8IYN2 117 aa6.1□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 COPS5Q92905 334 aa6.1□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 RPS6KC1Q96S38 1066 aa6.1□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 ARNT2Q9HBZ2 717 aa6.1□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.1□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa6.1□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 ABCA9Q8IUA7 1624 aa6.1□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 FANCAO15360 1455 aa6.09□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa6.09□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 SCAPERQ9BY12 1400 aa6.09□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 TNKSO95271 1327 aa6.09□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 M0R2C6 588 aa6.09□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 ARVCFO00192 962 aa6.09□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 SIGLEC6O43699 453 aa6.09□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 VAMP4O75379 141 aa6.09□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 RFPL1O75677 317 aa6.09□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 F2P00734 622 aa6.09□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 ATF3P18847 181 aa6.09□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 ADCYAP1R1P41586 468 aa6.09□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 ECI1P42126 302 aa6.09□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 SCNN1BP51168 640 aa6.09□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 RAC1P63000 192 aa6.09□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 DOC2BQ14184 412 aa6.09□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 FDX2Q6P4F2 183 aa6.09□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.09□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.09□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 NPLOC4Q8TAT6 608 aa6.09□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 WNK4Q96J92 1243 aa6.09□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 ZDHHC15Q96MV8 337 aa6.09□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.09□□□□□ -1.43
CLHC1-212ENST00000487320 MCMBPQ9BTE3 642 aa6.09□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms