RNA–Protein interactions for RNA: tT(AGU)C

tT(AGU)C, Transcript of Threonine tRNA (tRNA-Thr), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tT(AGU)C, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tT(AGU)CtT(AGU)C SWH1P35845 1188 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C OAF3P36023 863 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CAF4P36130 643 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C TFA2P36145 328 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YRO2P38079 344 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MAK5P38112 773 aaPredicted RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ARA1P38115 344 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ALG3P38179 458 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C OLA1P38219 394 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MUM2P38236 366 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C TRM7P38238 310 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YBR062CP38239 180 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YBP1P38315 674 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C HSM3P38348 480 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PPX1P38698 397 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RRP3P38712 501 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YHR112CP38716 378 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ARN1P38731 627 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YHR127WP38833 243 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data0.68□□□□□ -2.3not detected
tT(AGU)CtT(AGU)C HXT6P39003 570 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C HXT7P39004 570 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RGA1P39083 1007 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C DHH1P39517 506 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CEM1P39525 442 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C OAF1P39720 1047 aaPredicted RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SSP120P39931 234 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PAC1P39946 494 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C GIM4P40005 111 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YER034WP40022 185 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C NDE1P40215 560 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PEP8P40335 379 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C LTP1P40347 161 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MET18P40469 1032 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ICE2P40499 491 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C IRR1P40541 1150 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C IAH1P41734 238 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C REF2P42073 533 aaPredicted RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PFA3P42836 336 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PRM10P42946 383 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YFR018CP43599 363 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C OSW7P43611 510 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MET12P46151 657 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ARC1P46672 376 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YGL176CP46945 554 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ATG36P46983 293 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YJL049WP47048 450 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MAD3P47074 515 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YJR030CP47101 745 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C URB2P47108 1174 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C LIA1P47120 325 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CSN12P47130 423 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YJR149WP47177 404 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C GCV1P48015 400 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C DIA3P52290 468 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C COS12P53053 380 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C MDM34P53083 459 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SGF73P53165 657 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C CLD1P53264 445 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C FHN1P53279 174 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C TIM13P53299 105 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C BIO4P53630 237 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C HST3P53687 447 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C IGO1P53897 168 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C COG6P53959 839 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C KTR5P53966 522 aaPredicted RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C EFM6P53970 246 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C UBX4P54730 416 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ERG13P54839 491 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C AAT1Q01802 451 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C INA17Q02888 182 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C HOS3Q02959 697 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C GIP3Q03016 1276 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RSM10Q03201 203 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YML119WQ03208 357 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C VPS60Q03390 229 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YMR210WQ03649 449 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C FMN1Q03778 218 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C TRS23Q03784 219 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YMR155WQ03795 547 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ECM11Q04110 302 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C TAF11Q04226 346 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C EMI1Q04406 187 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C API2Q04413 109 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YDR124WQ04608 324 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C GSF2Q04697 403 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ROY1Q04847 553 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C BCH1Q05029 724 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C FAR8Q05040 523 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C GLO2Q05584 274 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C RRP45Q05636 305 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C PNP1Q05788 311 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C VID22Q05934 901 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C STE23Q06010 1027 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C ISR1Q06098 443 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C DIC1Q06143 298 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C SFH1Q06168 426 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C YPS7Q06325 596 aa0.68□□□□□ -2.3
tT(AGU)CtT(AGU)C HDA3Q06623 655 aa0.68□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.1 ms