RNA–Protein interactions for RNA: YJR132W

NMD5, Transcript of Karyopherin, yeastyeast

Gene NMD5, Length 3,147 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD5YJR132W PMR1P13586 950 aa6.64□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W CDC34P14682 295 aa6.64□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W IFM1P25038 676 aa6.64□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W CNB1P25296 175 aa6.64□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W BUD5P25300 642 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W PRR1P28708 518 aa6.64□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W GCG1P32656 232 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W YOX1P34161 385 aa6.64□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W FES1P38260 290 aa6.64□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W YHR045WP38775 560 aa6.64□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W RGI1P40043 161 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W SCS2P40075 244 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W SAD1P43589 448 aa6.64□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W EEB1Q02891 456 aa6.64□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W MRP51Q02950 344 aa6.64□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W CSC1Q06538 782 aa6.64□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W YEH1Q07804 573 aa6.64□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W YSP2Q06681 1438 aa6.64□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W RPP2AP05319 106 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W RAM1P22007 431 aa6.64□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W RNA15P25299 296 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W SGF29P25554 259 aa6.64□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W PER1P25625 357 aa6.64□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W HXT4P32467 576 aa6.64□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W FAT1P38225 669 aa6.64□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W ACO2P39533 789 aa6.64□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W YER121WP40076 114 aa6.64□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W YAP5P40574 245 aa6.64□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W YGL138CP53122 345 aa6.64□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W YAT1P80235 687 aa6.64□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W PLM2Q04383 521 aa6.64□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W FRE5Q08908 694 aa6.64□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W SIR4P11978 1358 aa6.64□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W GLN4P13188 809 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W GUK1P15454 187 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W IME1P21190 360 aa6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W TFC1P32367 649 aa6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W STB6P36085 766 aa6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W RPF2P36160 344 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W SEC72P39742 193 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W CLA4P48562 842 aa6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W BUD17P53727 317 aa6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W CUS2P53830 285 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W PRM15Q03262 622 aa6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W FMP42Q04991 504 aa6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W FAR10Q06001 478 aa6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W GLO4Q12320 285 aa6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W YOL114CQ12322 202 aa6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W GPM3Q12326 303 aa6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W PNO1Q99216 274 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W SPT3P06844 337 aa6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W RAD18P10862 487 aa6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W SRV2P17555 526 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W RCN1P36054 211 aa6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W MAL33P38157 468 aa6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W YBR287WP38355 427 aa6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W EPS1P40557 701 aa6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W CTS2Q06350 511 aa6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W YPR127WQ06494 345 aa6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W CDD1Q06549 142 aa6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W HUA2Q12134 243 aa6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W YOL159C-AQ3E769 90 aa6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W GPH1P06738 902 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W MET2P08465 486 aa6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W ANR2P36090 516 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W ECM13P38195 257 aa6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W SPP381P38282 291 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W CYC2P38909 366 aa6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W DLD3P39976 496 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W PKP2P53170 491 aa6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W CWC27Q02770 301 aa6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W MFG1Q07684 458 aa6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W MLH3Q12083 715 aa6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W WIP1Q2V2P8 89 aa6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W APM4Q99186 491 aa6.63□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W STU1P38198 1513 aa6.62□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W YLR278CQ05854 1341 aa6.62□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W STE2D6VTK4 431 aa6.62□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W SBP1P10080 294 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W PEX3P28795 441 aa6.62□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W PDB1P32473 366 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W SIP1P32578 815 aa6.62□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W PTK1P36002 662 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W YJL206CP39529 758 aa6.62□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W GVP36P40531 326 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W COS4P43542 379 aa6.62□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W ALT2P52892 507 aa6.62□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W YGL159WP53110 370 aa6.62□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W OGG1P53397 376 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W PRP38Q00723 242 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W YPL080CQ02826 108 aa6.62□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W ISU1Q03020 165 aa6.62□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W HDA3Q06623 655 aa6.62□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W UAF30Q08747 228 aa6.62□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W FYV7Q12247 151 aa6.62□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W DST1P07273 309 aa6.62□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W CBS2P14905 389 aa6.62□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W ARG8P18544 423 aa6.62□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W PRE8P23639 250 aa6.62□□□□□ -1.35
NMD5YJR132W RPN3P40016 523 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
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