RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	TRS85	P46944	698 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	YTP1	P53584	459 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	YPL014W	Q02606	381 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	REC102	Q02721	264 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	LCB4	Q12246	624 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	NCA2	Q12374	616 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	AHC1	Q12433	566 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	RRD2	Q12461	358 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	YCR051W	P25631	222 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	MSH1	P25846	959 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	URA10	P30402	227 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	OAF3	P36023	863 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	CAB3	P36076	571 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	FLO10	P36170	1169 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	YEL028W	P39989	153 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	YAT2	P40017	923 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	GID8	P40208	455 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	MOB1	P40484	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	DSN1	P40568	576 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	UFE1	P41834	346 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	ERR3	P42222	437 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	BST1	P43571	1029 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	URB2	P47108	1174 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	EFM6	P53970	246 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	ARP4	P80428	489 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	CDC14	Q00684	551 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	LDB18	Q07887	179 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	MLH3	Q12083	715 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	AMD2	P22580	549 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	ADY2	P25613	283 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	BEM3	P32873	1128 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	GLG1	P36143	616 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	MRPL40	P36534	297 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	SMF2	P38778	549 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	STL1	P39932	569 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	FMP10	P40098	244 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	RRT5	P43607	289 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	ASG7	P46993	209 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	ATG4	P53867	494 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	MRS2	Q01926	470 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	HER2	Q03557	464 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	ARA2	Q04212	335 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	FAR8	Q05040	523 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	YDR278C	Q05612	105 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	ARO10	Q06408	635 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	PGC1	Q08959	321 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CPR4	YCR069W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
CPR4	YCR069W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	CBF1	P17106	351 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	URK1	P27515	501 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	EMP70	P32802	667 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	MRE11	P32829	692 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	APM3	P38153	483 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	PPE1	P38796	400 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	EXO1	P39875	702 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	SNG1	P46950	547 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	IMO32	P53219	342 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	COX18	P53239	316 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	PNG1	Q02890	363 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	TAF11	Q04226	346 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	BSP1	Q06604	576 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	YDL121C	Q07541	149 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CPR4	YCR069W	TRE2	Q08693	809 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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