RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 MIGA2Q7L4E1 593 aa32.29■■■□□ 2.76
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CCDC34Q96HJ3 373 aa32.29■■■□□ 2.76
CTDNEP1-210ENST00000574322 GOPCQ9HD26 462 aa32.29■■■□□ 2.76
CTDNEP1-210ENST00000574322 GINM1Q9NU53 330 aa32.29■■■□□ 2.76
CTDNEP1-210ENST00000574322 A0A087X0B3 334 aa32.29■■■□□ 2.76
CTDNEP1-210ENST00000574322 RAD21O60216 631 aa32.29■■■□□ 2.76
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CTDNEP1-210ENST00000574322 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa32.29■■■□□ 2.76
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CTDNEP1-210ENST00000574322 DEFB129Q9H1M3 183 aa32.21■■■□□ 2.75
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ADM5C9JUS6 153 aa32.17■■■□□ 2.74
CTDNEP1-210ENST00000574322 MEIS2O14770 477 aa32.17■■■□□ 2.74
CTDNEP1-210ENST00000574322 PLA2G4DQ86XP0 818 aa32.17■■■□□ 2.74
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM43AQ8N2R8 423 aa32.17■■■□□ 2.74
CTDNEP1-210ENST00000574322 HOOK2Q96ED9 719 aa32.17■■■□□ 2.74
CTDNEP1-210ENST00000574322 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
CTDNEP1-210ENST00000574322 SMTNL1A8MU46 457 aa32.16■■■□□ 2.74
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