RNA–Protein interactions for RNA: tS(GCU)Q1

tS(GCU)Q1, Transcript of Mitochondrial serine tRNA (tRNA-Ser), yeastyeast

Gene tS(GCU)Q1, Length 86 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TFB2Q02939 513 aa-0.33□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RRP6Q12149 733 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YLR108CQ12259 485 aa-0.33□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DBP10Q12389 995 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CHS1P08004 1131 aa-0.34□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 APE1P14904 514 aa-0.34□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SRP54P20424 541 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DPH2P32461 534 aa-0.34□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FRD1P32614 470 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 UTR5P32630 166 aa-0.34□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CYM1P32898 989 aa-0.34□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SER1P33330 395 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ATG12P38316 186 aa-0.34□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FMP10P40098 244 aa-0.34□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YPL108WQ02872 168 aaPredicted RBP-0.34□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ATG23Q06671 453 aa-0.34□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YDL057WQ07379 328 aa-0.34□□□□□ -2.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VAS1P07806 1104 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 UBA4P38820 440 aa-0.35□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 STL1P39932 569 aa-0.35□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 UTP18P40362 594 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 WWM1P43582 211 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DLD2P46681 530 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CAF40P53829 373 aa-0.35□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MDG1P53885 366 aa-0.35□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 INN1P53901 409 aa-0.35□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MRPL51Q06090 140 aaPredicted RBP-0.35□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CRD1Q07560 283 aa-0.35□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CBP6P07253 162 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SNF3P10870 884 aa-0.36□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YEF3P16521 1044 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 APA1P16550 321 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ARP1P38696 384 aa-0.36□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SCC4P40090 624 aa-0.36□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CPR7P47103 393 aa-0.36□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BAT2P47176 376 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NNF2P53253 936 aa-0.36□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MTG1Q03151 367 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MTQ2Q03920 221 aaPredicted RBP-0.36□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MLC2Q06580 163 aa-0.36□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SLF1Q12034 447 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ADE3P07245 946 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PRY2P36110 329 aa-0.37□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NAT2P37293 288 aa-0.37□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ROT2P38138 954 aa-0.37□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ELO1P39540 310 aa-0.37□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BRO1P48582 844 aa-0.37□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YMR160WQ03823 816 aa-0.37□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 POB3Q04636 552 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ADE13Q05911 482 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BNA5Q05979 453 aa-0.37□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VPS74Q06385 345 aa-0.37□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 THP3Q12049 470 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YPR027CQ12079 277 aa-0.37□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YPR096CO13587 100 aa-0.38□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HEM12P32347 362 aaPredicted RBP-0.38□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 LAG1P38703 411 aa-0.38□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RIC1P40395 1056 aa-0.38□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YJL144WP47009 104 aa-0.38□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YPL107WQ02873 248 aa-0.38□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HER2Q03557 464 aa-0.38□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ADH3P07246 375 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SCH9P11792 824 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 AAP1P37898 856 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ECM10P39987 644 aa-0.39□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 IBD2P53892 351 aa-0.39□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PIR3Q03180 325 aa-0.39□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ICL2Q12031 575 aa-0.39□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YML003WP0CF16 290 aa-0.4□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MNS1P32906 549 aa-0.4□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HEL1P36113 551 aa-0.4□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TAF5P38129 798 aa-0.4□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MSG5P38590 489 aa-0.4□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DFG10P40526 253 aa-0.4□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YFR020WP43600 232 aa-0.4□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RSM28Q03430 361 aa-0.4□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 IRC25Q07951 179 aa-0.4□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RRD2Q12461 358 aa-0.4□□□□□ -2.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ART10P18634 518 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 AGA2P32781 87 aa-0.41□□□□□ -2.48
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GAT2P40209 560 aa-0.41□□□□□ -2.48
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PRM5P40476 318 aa-0.41□□□□□ -2.48
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SNU71P53207 620 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RHO4Q00246 291 aa-0.41□□□□□ -2.48
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YVH1Q02256 364 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPN4Q03465 531 aa-0.41□□□□□ -2.48
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SSP2Q08646 371 aa-0.41□□□□□ -2.48
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VPS54Q12071 889 aa-0.41□□□□□ -2.48
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPS8AP0CX39 200 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPS8BP0CX40 200 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SMY1P32364 656 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ARP2P32381 391 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YER186CP40101 306 aa-0.42□□□□□ -2.48
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SMC3P47037 1230 aa-0.42□□□□□ -2.48
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YJR030CP47101 745 aa-0.42□□□□□ -2.48
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CTF18P49956 741 aa-0.42□□□□□ -2.48
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YGR018CP53211 109 aa-0.42□□□□□ -2.48
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GOR1P53839 350 aa-0.42□□□□□ -2.48
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP-0.42□□□□□ -2.48
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NUP145P49687 1317 aa-0.42□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 36.3 ms