RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W INO1P11986 533 aa8.9□□□□□ -0.98
YLR349WYLR349W PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
YLR349WYLR349W HRR25P29295 494 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
YLR349WYLR349W SMI1P32566 505 aa8.9□□□□□ -0.98
YLR349WYLR349W CAB3P36076 571 aa8.9□□□□□ -0.98
YLR349WYLR349W YMR134WP40207 237 aa8.9□□□□□ -0.98
YLR349WYLR349W RPC17P47076 161 aa8.9□□□□□ -0.98
YLR349WYLR349W MRS2Q01926 470 aa8.9□□□□□ -0.98
YLR349WYLR349W NHX1Q04121 633 aa8.9□□□□□ -0.98
YLR349WYLR349W YDR056CQ12025 205 aa8.9□□□□□ -0.98
YLR349WYLR349W YOR114WQ12219 294 aa8.9□□□□□ -0.98
YLR349WYLR349W RPS4AP0CX35 261 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W RPS4BP0CX36 261 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W KIN2P13186 1147 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W AGP1P25376 633 aa8.89□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W SFA1P32771 386 aa8.89□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W LRG1P35688 1017 aa8.89□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W YRO2P38079 344 aa8.89□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W RGA1P39083 1007 aa8.89□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W SCC4P40090 624 aa8.89□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W GAT1P43574 510 aa8.89□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W PEX8P53248 589 aa8.89□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W BTN2P53286 410 aa8.89□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W SED5Q01590 340 aa8.89□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W GIC2Q06648 383 aa8.89□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W IRC13Q08630 104 aa8.89□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W TY4A-HQ6Q5P6 413 aa8.89□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W YAR066WP0CX18 203 aa8.88□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W YHR214WP0CX19 203 aa8.88□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W HSE1P38753 452 aa8.88□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W DHH1P39517 506 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W OSW7P43611 510 aa8.88□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W PRO2P54885 456 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W TFB2Q02939 513 aa8.88□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W BDS1Q08347 646 aa8.88□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W YPT1P01123 206 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W MET8P15807 274 aa8.87□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W CLN2P20438 545 aa8.87□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W YHR127WP38833 243 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W SER3P40054 469 aa8.87□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W VPS38Q05919 439 aa8.87□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W RAX1Q08760 435 aa8.87□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W PST1Q12355 444 aa8.87□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W COX1P00401 534 aa8.86□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W HOM3P10869 527 aa8.86□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data8.86□□□□□ -0.99not detected
YLR349WYLR349W RRP1P35178 278 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W YPT52P36018 234 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W ARL1P38116 183 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W MSG5P38590 489 aa8.86□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W MNL1P38888 796 aa8.86□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W MBP1P39678 833 aa8.86□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W GAD1Q04792 585 aa8.86□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W MPC54Q08550 464 aa8.86□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W IMA3P0CW40 589 aa8.85□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W IMA4P0CW41 589 aa8.85□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W MXR2P25566 168 aa8.85□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W YCL042WP25572 119 aa8.85□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W MF(ALPHA)2P32435 120 aa8.85□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W SKT5P34226 696 aa8.85□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W TOM20P35180 183 aa8.85□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W THI80P35202 319 aa8.85□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W SOL2P37262 315 aa8.85□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W PCH2P38126 564 aa8.85□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W MOH1P38191 138 aa8.85□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W TIF11P38912 153 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W SEC24P40482 926 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W EFM4P40516 257 aa8.85□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W RIM8P53179 542 aa8.85□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W ATF2P53296 535 aa8.85□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W TPP1Q03796 238 aa8.85□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W YDR109CQ04585 715 aa8.85□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W YDL218WQ07629 317 aa8.85□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W IMA2Q08295 589 aa8.85□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W NUS1Q12063 375 aa8.85□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W HUA2Q12134 243 aa8.85□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W LAT1P12695 482 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W CDC26P14724 124 aa8.84□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W CLB1P24868 471 aa8.84□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W PEX5P35056 612 aa8.84□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W EAP1P36041 632 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W EDS1P38073 919 aa8.84□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data8.84□□□□□ -0.99not detected
YLR349WYLR349W SPF1P39986 1215 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W ARH1P48360 493 aa8.84□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W VPS73P53142 486 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W FDC1Q03034 503 aa8.84□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W YMR114CQ04471 368 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
YLR349WYLR349W BAS1P22035 811 aa8.83□□□□□ -1
YLR349WYLR349W CDC20P26309 610 aa8.83□□□□□ -1
YLR349WYLR349W INM1P38710 295 aa8.83□□□□□ -1
YLR349WYLR349W VRG4P40107 337 aa8.83□□□□□ -1
YLR349WYLR349W SEC9P40357 651 aa8.83□□□□□ -1
YLR349WYLR349W YDR338CQ05497 695 aa8.83□□□□□ -1
YLR349WYLR349W OMS1Q06668 471 aa8.83□□□□□ -1
YLR349WYLR349W PUS7Q08647 676 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
YLR349WYLR349W AKR2Q12013 749 aa8.83□□□□□ -1
YLR349WYLR349W YPR022CQ12139 1133 aa8.83□□□□□ -1
YLR349WYLR349W CDC21P06785 304 aa8.82□□□□□ -1
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 36.1 ms