RNA–Protein interactions for RNA: YKR049C

FMP46, Transcript of Putative redox protein containing a thioredoxin fold, yeast

Gene FMP46, Length 402 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FMP46	YKR049C	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	UPC2	Q12151	913 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	UBR1	P19812	1950 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	MDM35	O60200	86 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	RHO2	P06781	192 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	SPT3	P06844	337 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	VAC17	P25591	423 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	YSC84	P32793	468 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	MRE11	P32829	692 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	MRPL37	P36532	105 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	CTP1	P38152	299 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	YBR062C	P38239	180 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	HSM3	P38348	480 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	UBA4	P38820	440 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	VPS41	P38959	992 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	YDR089W	P38966	869 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	COA1	P40452	197 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	NUP85	P46673	744 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	SHY1	P53266	389 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	HST3	P53687	447 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	SWS2	P53937	143 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	TAF12	Q03761	539 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	VHS1	Q03785	461 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	VAM6	Q07468	1049 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	YDL129W	Q07555	291 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	ENT4	Q07872	247 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	TFB4	Q12004	338 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	APC9	Q12107	265 aa		4.18	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	AI3	P03877	415 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	STE3	P06783	470 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	NMT1	P14743	455 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	CLN2	P20438	545 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	SEC15	P22224	910 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	PPH21	P23594	369 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	CLB1	P24868	471 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	ATP11	P32453	318 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	NUP120	P35729	1037 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	SOL2	P37262	315 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	BZZ1	P38822	633 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	ELO1	P39540	310 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	YAL037W	P39728	267 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	EMP65	P40085	556 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	MGS1	P40151	587 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	PRM2	P40534	656 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	SSU1	P41930	458 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	SUM1	P46676	1062 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	TIS11	P47977	285 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	AIF1	P52923	378 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	MDM34	P53083	459 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	YGR015C	P53208	328 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	GTR2	P53290	341 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	IBD2	P53892	351 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	MRS2	Q01926	470 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	YPL109C	Q02981	657 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	GAS3	Q03655	524 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	PST1	Q12355	444 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	YPT6	Q99260	215 aa		4.17	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	CDC21	P06785	304 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	PBS2	P08018	668 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	EXO70	P19658	623 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	PTH2	P34222	208 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	RRN3	P36070	627 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	PIM1	P36775	1133 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	AXL2	P38928	823 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	GCD10	P41814	478 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	PFA3	P42836	336 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	STB2	P46679	850 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	YJR149W	P47177	404 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	MRM2	P53123	320 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	SUN4	P53616	420 aa		4.16	□□□□□ -1.74
FMP46	YKR049C	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74

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