RNA–Protein interactions for RNA: YGL093W

SPC105, Transcript of Subunit of a kinetochore-microtubule binding complex, yeastyeast

Gene SPC105, Length 2,754 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC105YGL093W ARX1Q03862 593 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W HDA3Q06623 655 aa4.05□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W XYL2Q07993 356 aa4.05□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W RTT10Q08924 1013 aa4.05□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W RHO2P06781 192 aa4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W SPT3P06844 337 aa4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W SSH4P32343 579 aa4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W PHO89P38361 574 aa4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W NPT1P39683 429 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W COA1P40452 197 aa4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W SSU1P41930 458 aa4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W YJR149WP47177 404 aa4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W GTR2P53290 341 aa4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W FRE4P53746 719 aa4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W EGD1Q02642 157 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W IRC15Q02733 499 aa4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W YML131WQ03102 365 aa4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W YMR209CQ03648 457 aa4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W VAM6Q07468 1049 aa4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W THI73Q07904 523 aa4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W UAF30Q08747 228 aa4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W COX6P00427 148 aa4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W SEC53P07283 254 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W ARG1P22768 420 aa4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W SEC14P24280 304 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W SPS22P25380 463 aa4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W MCM5P29496 775 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W YBR071WP38243 211 aa4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W NDE1P40215 560 aa4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W PFK26P40433 827 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W GAT1P43574 510 aa4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W MTR3P48240 250 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W YGR015CP53208 328 aa4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W NOP19P53317 196 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W RPM2Q02773 1202 aa4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W VPS16Q03308 798 aa4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W YMR155WQ03795 547 aa4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W TRM12Q04235 462 aa4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W YMR034CQ05131 434 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W YIG1Q08956 461 aa4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W SUL2Q12325 893 aa4.04□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W EXO70P19658 623 aa4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W AAD3P25612 363 aa4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W CIN8P27895 1000 aa4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W SPT16P32558 1035 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W NTR2P36118 322 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W EFM1P38732 585 aa4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W YPT35P38815 214 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W GIP4P39732 760 aa4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W CCT7P42943 550 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W MRS2Q01926 470 aa4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W PSR1Q07800 427 aa4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W NOB1Q08444 459 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W YDR056CQ12025 205 aa4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W ATG29Q12092 213 aa4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W FAB1P34756 2278 aa4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W TUB1P09733 447 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W PTM1P32857 523 aa4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W FRE2P36033 711 aa4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W RIM11P38615 370 aa4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W YHR127WP38833 243 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W YEN1P40028 759 aa4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W TIF34P40217 347 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W IAH1P41734 238 aa4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W SUM1P46676 1062 aa4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W DAN4P47179 1161 aa4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W VAC7P53950 1165 aa4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W LSM3P57743 89 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W RMI1Q02685 241 aa4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W GOT1Q03554 138 aa4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W RSC3Q06639 885 aa4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W TFB4Q12004 338 aa4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W TRM8Q12009 286 aa4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W CHS5Q12114 671 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W LEU9Q12166 604 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
SPC105YGL093W FUR1P18562 216 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
SPC105YGL093W DBR1P24309 405 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
SPC105YGL093W PHO91P27514 894 aa4.02□□□□□ -1.77
SPC105YGL093W YHR112CP38716 378 aa4.02□□□□□ -1.77
SPC105YGL093W GGC1P38988 300 aa4.02□□□□□ -1.77
SPC105YGL093W MET18P40469 1032 aa4.02□□□□□ -1.77
SPC105YGL093W MNT3P40549 630 aa4.02□□□□□ -1.77
SPC105YGL093W GCD10P41814 478 aa4.02□□□□□ -1.77
SPC105YGL093W NPY1P53164 384 aa4.02□□□□□ -1.77
SPC105YGL093W YGR012WP53206 393 aa4.02□□□□□ -1.77
SPC105YGL093W YGR053CP53234 283 aa4.02□□□□□ -1.77
SPC105YGL093W YNL260CP53846 198 aa4.02□□□□□ -1.77
SPC105YGL093W MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
SPC105YGL093W UBX3Q12229 455 aa4.02□□□□□ -1.77
SPC105YGL093W YPT6Q99260 215 aa4.02□□□□□ -1.77
SPC105YGL093W CLN2P20438 545 aa4.02□□□□□ -1.77
SPC105YGL093W RSC6P25632 483 aa4.02□□□□□ -1.77
SPC105YGL093W CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data4.02□□□□□ -1.77not detected
SPC105YGL093W RMA1P36001 430 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
SPC105YGL093W TRM7P38238 310 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
SPC105YGL093W YHR033WP38690 423 aa4.02□□□□□ -1.77
SPC105YGL093W ARN1P38731 627 aa4.02□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.9 ms