RNA–Protein interactions for RNA: YDL137W

ARF2, Transcript of ADP-ribosylation factor, yeast

Gene ARF2, Length 546 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ARF2	YDL137W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	ASK1	P35734	292 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	RRN3	P36070	627 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	PHO89	P38361	574 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	DBP8	P38719	431 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	EFM1	P38732	585 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	SPC97	P38863	823 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	YJL070C	P40361	888 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	DSN1	P40568	576 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	GTS1	P40956	396 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	SLT2	Q00772	484 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	RNT1	Q02555	471 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	TFB2	Q02939	513 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	CSN9	Q03981	162 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	BUD7	Q08754	746 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	TRM8	Q12009	286 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	UBX3	Q12229	455 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	RMD5	Q12508	421 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	RGS2	Q99188	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	STE2	D6VTK4	431 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
ARF2	YDL137W	EPT1	P22140	391 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	AMD2	P22580	549 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	PHA2	P32452	334 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	SLD2	P34252	453 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	YSW1	P38280	609 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	PFS1	P38872	237 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	CYC2	P38909	366 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	PEP8	P40335	379 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	YFR018C	P43599	363 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	AIF1	P52923	378 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	YGL108C	P53139	140 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	YPL113C	Q02961	396 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	GOT1	Q03554	138 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	TAF11	Q04226	346 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	EMI1	Q04406	187 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	ARG7	Q04728	441 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	MFB1	Q04922	465 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	FAR8	Q05040	523 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	NUT2	Q06213	157 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	RSC3	Q06639	885 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	APC9	Q12107	265 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	ICT1	Q12385	394 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ARF2	YDL137W	YPR089W	O13585	888 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	SEM1	O94742	89 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	CIN8	P27895	1000 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	ATP11	P32453	318 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	YSC84	P32793	468 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	STB6	P36085	766 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	GMH1	P36125	273 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	IML3	P38265	245 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	YHR182W	P38870	785 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	STN1	P38960	494 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	RPH1	P39956	796 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	HAT2	P39984	401 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	YIL165C	P40446	119 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	TED1	P40533	473 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	PRM2	P40534	656 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	BOL2	P53082	120 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.52	□□□□□ -1.69	not detected
ARF2	YDL137W	YDR131C	Q03899	556 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	YLR177W	Q06251	628 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	MDY2	Q12285	212 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	STT4	P37297	1900 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	ABF1	P14164	731 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	SNT1	P25357	1226 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	SPR1	P32603	445 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	PTM1	P32857	523 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	TIP20	P33891	701 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ARF2	YDL137W	PTH2	P34222	208 aa		4.51	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.5 ms