RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 FAM50BQ9Y247 325 aa14.33□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 KIF28PB7ZC32 967 aa14.32□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 SLC25A27O95847 323 aa14.32□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 TMEM132BQ14DG7 1078 aa14.32□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 GNASQ5JWF2 1037 aa14.32□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 ATG4CQ96DT6 458 aa14.32□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 CIAO1O76071 339 aa14.31□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 ACTN1P12814 892 aa14.31□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 ITGA7Q13683 1181 aa14.31□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 PLS1Q14651 629 aa14.31□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 RAB3GAP1Q15042 981 aa14.31□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 CXCL17Q6UXB2 119 aa14.31□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 DEFB128Q7Z7B8 93 aa14.31□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa14.31□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 TRIM34Q9BYJ4 488 aa14.31□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 FBXO3Q9UK99 471 aa14.31□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 ASTN1O14525 1302 aa14.31□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 A0A1W2PRG0 241 aa14.3□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 CABYRO75952 493 aa14.3□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa14.3□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 RIOX2Q8IUF8 465 aa14.3□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa14.3□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.3□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 SPC25Q9HBM1 224 aa14.3□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 TNKSO95271 1327 aa14.3□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 CEP250Q9BV73 2442 aa14.3□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 H0Y858 1186 aa14.29□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 BAIAP3O94812 1187 aa14.29□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 RFC2P35250 354 aa14.29□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 BEX3Q00994 111 aa14.29□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 KCTD2Q14681 263 aa14.29□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 SLC4A10Q6U841 1118 aa14.29□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 PI16Q6UXB8 463 aa14.29□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 KATNBL1Q9H079 304 aa14.29□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 TLR9Q9NR96 1032 aa14.29□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP14.29□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 MTUS1Q9ULD2 1270 aa14.29□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa14.29□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 TET1Q8NFU7 2136 aa14.29□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa14.28□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 LINC01553A4QN01 128 aa14.28□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 HLA-DOAP06340 250 aa14.28□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 AVPR2P30518 371 aa14.28□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 PPP4CP60510 307 aa14.28□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 ACVR2BQ13705 512 aa14.28□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 NBR1Q14596 966 aa14.28□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 CCDC144BQ3MJ40 725 aa14.28□□□□□ -0.12
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HCG18-241ENST00000602290 ASIC4Q96FT7 647 aa14.28□□□□□ -0.12
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HCG18-241ENST00000602290 EHD4Q9H223 541 aa14.28□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 HMG20BQ9P0W2 317 aa14.28□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.28□□□□□ -0.12
HCG18-241ENST00000602290 LTBRP36941 435 aa14.27□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 NUBP1P53384 320 aa14.27□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 ZXDAP98168 799 aa14.27□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 ABCB5Q2M3G0 1257 aa14.27□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 TIGD5Q53EQ6 642 aa14.27□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa14.27□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa14.27□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 ADGRA1Q86SQ6 560 aa14.27□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 SIL1Q9H173 461 aa14.27□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
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HCG18-241ENST00000602290 CYP2C9P11712 490 aa14.26□□□□□ -0.13
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HCG18-241ENST00000602290 MAGEB6Q8N7X4 407 aa14.26□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 REPS2Q8NFH8 660 aa14.26□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 COL26A1Q96A83 441 aa14.26□□□□□ -0.13
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HCG18-241ENST00000602290 SHMT1P34896 483 aa14.25□□□□□ -0.13
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HCG18-241ENST00000602290 TCEAL5Q5H9L2 206 aa14.25□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa14.25□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 ADSSL1Q8N142 457 aa14.25□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa14.25□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 RAI14Q9P0K7 980 aa14.25□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 SERPINB13Q9UIV8 391 aa14.25□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 MCM3APO60318 1980 aa14.24□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 GJB5O95377 273 aa14.24□□□□□ -0.13
HCG18-241ENST00000602290 COPB2P35606 906 aa14.24□□□□□ -0.13
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