RNA–Protein interactions for RNA: YNL093W

YPT53, Transcript of Stress-induced Rab family GTPase, yeast

Gene YPT53, Length 663 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YPT53	YNL093W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	APA2	P22108	325 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	CPR2	P23285	205 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	YCR051W	P25631	222 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	KRE2	P27809	442 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	HCS1	P34243	683 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	VPS51	P36116	164 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	CAF4	P36130	643 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	MRPL36	P36531	177 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	NDC80	P40460	691 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	CHS6	P40955	746 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	COX16	P47081	118 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	RSM26	P47141	266 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	MRX6	P48564	524 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	YGL138C	P53122	345 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	BET4	Q00618	327 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	FMP30	Q02883	468 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	KAP120	Q02932	1032 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	YMR102C	Q03177	834 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	BNA7	Q04066	261 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	ARG7	Q04728	441 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	ATG33	Q06485	197 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	OMS1	Q06668	471 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	CTI6	Q08923	506 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	DDC1	Q08949	612 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	TGS1	Q12052	315 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	ULA1	Q12059	462 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	SWT1	Q12104	458 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	NCB2	Q92317	146 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	MTR10	Q99189	972 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	AFI1	Q99222	893 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	YPR089W	O13585	888 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	WHI2	P12611	486 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	DAP2	P18962	818 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	ERV1	P27882	189 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	KIP1	P28742	1111 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	CTS1	P29029	562 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	HXT4	P32467	576 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	YHL012W	P38709	493 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	YHR045W	P38775	560 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	YHR202W	P38887	602 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	CIN5	P40917	295 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	OTU1	P43558	301 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	CAF16	P43569	289 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	MDV1	P47025	714 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	IBA57	P47158	497 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	GNP1	P48813	663 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	LIF1	P53150	421 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	MPS2	P53159	387 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	COQ6	P53318	479 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	MRS2	Q01926	470 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	VPS60	Q03390	229 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	PEX19	Q07418	342 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	GUP2	Q08929	609 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	RCN2	Q12044	265 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	AEP3	Q12089	606 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	UBX3	Q12229	455 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	RAD50	P12753	1312 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	PHO5	P00635	467 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	RAD7	P06779	565 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	CBS1	P14066	229 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	BET2	P20133	325 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	SIN4	P32259	974 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	VPH2	P32341	215 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	HOG1	P32485	435 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	CYM1	P32898	989 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	MDL2	P33311	773 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	YKL107W	P34251	309 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	YKL077W	P36081	392 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	PET10	P36139	283 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	MRPL10	P36520	322 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	BMT2	P38278	337 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YPT53	YNL093W	TAE1	P38340	232 aa		4.03	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.2 ms