RNA–Protein interactions for RNA: YML009C

MRPL39, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit, yeast

Gene MRPL39, Length 213 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPL39	YML009C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	EMC3	P36039	253 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	YHI9	P38765	294 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	GIC1	P38785	314 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	YHR182W	P38870	785 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.67	not detected
MRPL39	YML009C	HAT2	P39984	401 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	YNL320W	P42840	284 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	RTS3	P53289	263 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	HST2	P53686	357 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	SPP2	Q02521	185 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	ROT1	Q03691	256 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	STP3	Q05937	343 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	DIC1	Q06143	298 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	RSC2	Q06488	889 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	ATG23	Q06671	453 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	PFA4	Q12006	378 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	SWI5	P08153	709 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	PET111	P08468	800 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	RSR1	P13856	272 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	AMS1	P22855	1083 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	MRPL25	P23369	157 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	PHO3	P24031	467 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	ATP11	P32453	318 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	YHR033W	P38690	423 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	EFM1	P38732	585 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	MNN1	P39106	762 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	PFA3	P42836	336 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	ALR2	P43553	858 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	ECM9	Q02202	377 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	BSC6	Q08280	497 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	YDR056C	Q12025	205 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	MCD1	Q12158	566 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	SUL2	Q12325	893 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	GPR1	Q12361	961 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	RMP1	Q12530	201 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	STE2	D6VTK4	431 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	RAD1	P06777	1100 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	MST1	P07236	462 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	HEM15	P16622	393 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	PTP1	P25044	335 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	RNQ1	P25367	405 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	SKT5	P34226	696 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	YKL100C	P34248	587 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	SQT1	P35184	431 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	UBS1	P38290	277 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	RIM11	P38615	370 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	HSE1	P38753	452 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	MEP1	P40260	492 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	LRO1	P40345	661 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	CFD1	P40558	293 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	BOL2	P53082	120 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	HST3	P53687	447 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	SHR3	Q02774	210 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	NHP10	Q03435	203 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	RRN11	Q04712	507 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	YLR177W	Q06251	628 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	YOL036W	Q08206	761 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	NUR1	Q12066	484 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	ICT1	Q12385	394 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	RIP1	P08067	215 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	ADH4	P10127	382 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	HOP1	P20050	605 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	NTH1	P32356	751 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	SKN1	P33336	771 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	TAF14	P35189	244 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	THI80	P35202	319 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	UBA4	P38820	440 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
MRPL39	YML009C	HOS4	P40480	1083 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67

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