RNA–Protein interactions for RNA: YBR273C

UBX7, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeast

Gene UBX7, Length 1,311 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX7	YBR273C	PMA2	P19657	947 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	POL4	P25615	582 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	PTH2	P34222	208 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	PTC1	P35182	281 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	TDP1	P38319	544 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	UBX7	P38349	436 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YBR285W	P38354	144 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YHL041W	P38730	149 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	MUP3	P38734	546 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	SFB3	P38810	929 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	ECM10	P39987	644 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	RIC1	P40395	1056 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	CDC1	P40986	491 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	IRC5	P43610	853 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	RTT101	P47050	842 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	NAS6	P50086	228 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	STB4	P50104	949 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	MRK1	P50873	501 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	RMR1	P53060	241 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	BOL2	P53082	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	GND2	P53319	492 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	ORC3	P54790	616 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	RMI1	Q02685	241 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	INA17	Q02888	182 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YML131W	Q03102	365 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	UGO1	Q03327	502 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	TRS31	Q03337	283 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	SMP3	Q04174	516 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	ARA2	Q04212	335 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	ECM30	Q06673	1274 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YDL114W	Q07530	308 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	LDB18	Q07887	179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	SGT1	Q08446	395 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	MET32	Q12041	191 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	REC8	Q12188	680 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YOR022C	Q12204	715 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	ABF1	P14164	731 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	PHO81	P17442	1178 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	UGA1	P17649	471 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	CCA1	P21269	546 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	COX13	P32799	129 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	RIB7	P33312	244 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	PEX6	P33760	1030 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	SKG1	P36169	355 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YBL029W	P38201	376 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	STB5	P38699	743 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YHL026C	P38740	315 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	VAC8	P39968	578 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	STB1	P42845	420 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YFL040W	P43562	540 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	PET130	P47065	347 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	GCV2	P49095	1034 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YGR053C	P53234	283 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	SPC98	P53540	846 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	HST3	P53687	447 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	IBD2	P53892	351 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YDR131C	Q03899	556 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	BLS1	Q06071	122 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	PUS5	Q06244	254 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	SWC7	Q06707	132 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	LOT6	Q07923	191 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	RSA1	Q08932	381 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	PGC1	Q08959	321 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	ICL2	Q12031	575 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	SVS1	Q12254	260 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	HER1	Q12276	1246 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	NTO1	Q12311	748 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	YPL247C	Q12523	523 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	AFI1	Q99222	893 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	VCX1	Q99385	411 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UBX7	YBR273C	COX5A	P00424	153 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	TRP3	P00937	484 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	HAP2	P06774	265 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	HVG1	P0CE11	249 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	RAP1	P11938	827 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	CMK2	P22517	447 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	SGF29	P25554	259 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	BEM1	P29366	551 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	PTP2	P29461	750 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	DSS4	P32601	143 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	TFB1	P32776	642 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UBX7	YBR273C	DUR3	P33413	735 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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