RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 CDC25BP30305 580 aa9.36□□□□□ -0.91
PDE4D-208ENST00000502484 PTGDRQ13258 359 aa9.36□□□□□ -0.91
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF174Q15697 407 aa9.36□□□□□ -0.91
PDE4D-208ENST00000502484 USP17L2Q6R6M4 530 aa9.36□□□□□ -0.91
PDE4D-208ENST00000502484 NIM1KQ8IY84 436 aa9.36□□□□□ -0.91
PDE4D-208ENST00000502484 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa9.36□□□□□ -0.91
PDE4D-208ENST00000502484 IDI2Q9BXS1 227 aa9.36□□□□□ -0.91
PDE4D-208ENST00000502484 SERPINA10Q9UK55 444 aa9.36□□□□□ -0.91
PDE4D-208ENST00000502484 BIN1O00499 593 aa9.35□□□□□ -0.91
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PDE4D-208ENST00000502484 ZMYND12Q9H0C1 365 aa9.35□□□□□ -0.91
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PDE4D-208ENST00000502484 ASPRV1Q53RT3 343 aa9.34□□□□□ -0.91
PDE4D-208ENST00000502484 NT5DC1Q5TFE4 455 aa9.34□□□□□ -0.91
PDE4D-208ENST00000502484 SPC24Q8NBT2 197 aa9.34□□□□□ -0.91
PDE4D-208ENST00000502484 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
PDE4D-208ENST00000502484 CPVLQ9H3G5 476 aa9.34□□□□□ -0.91
PDE4D-208ENST00000502484 SERTAD1Q9UHV2 236 aa9.34□□□□□ -0.91
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PDE4D-208ENST00000502484 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa9.34□□□□□ -0.91
PDE4D-208ENST00000502484 COL4A5P29400 1685 aa9.34□□□□□ -0.91
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa9.34□□□□□ -0.91
PDE4D-208ENST00000502484 hCG_1984214I3L0E3 225 aa9.34□□□□□ -0.91
PDE4D-208ENST00000502484 FOXN1O15353 648 aa9.34□□□□□ -0.91
PDE4D-208ENST00000502484 SARSP49591 514 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
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PDE4D-208ENST00000502484 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
PDE4D-208ENST00000502484 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
PDE4D-208ENST00000502484 EPSTI1Q96J88 318 aa9.34□□□□□ -0.91
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC17Q96LX7 622 aa9.34□□□□□ -0.91
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
PDE4D-208ENST00000502484 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
PDE4D-208ENST00000502484 FAM198AQ9UFP1 575 aa9.34□□□□□ -0.91
PDE4D-208ENST00000502484 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
PDE4D-208ENST00000502484 ZNRF3Q9ULT6 936 aa9.34□□□□□ -0.91
PDE4D-208ENST00000502484 A0A087X0B3 334 aa9.33□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 VWA3AA6NCI4 1184 aa9.33□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 YDJCA8MPS7 323 aa9.33□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 SMTNL1A8MU46 457 aa9.33□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 NCAPHQ15003 741 aa9.33□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa9.33□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 ZFPM1Q8IX07 1006 aa9.33□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 PDILTQ8N807 584 aa9.33□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 C4orf32Q8N8J7 132 aa9.33□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 SPATA20Q8TB22 786 aa9.33□□□□□ -0.92
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PDE4D-208ENST00000502484 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 GNA11P29992 359 aa9.33□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 MCM7P33993 719 aa9.33□□□□□ -0.92
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PDE4D-208ENST00000502484 NAPAP54920 295 aa9.33□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 TRIML1Q8N9V2 468 aa9.33□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC34Q96HJ3 373 aa9.33□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 PIGSQ96S52 555 aa9.33□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 KCNF1Q9H3M0 494 aa9.33□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 C6orf50Q9HD87 102 aa9.33□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 PI4KBQ9UBF8 816 aa9.33□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 CLIP2Q9UDT6 1046 aa9.33□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 ATRNL1Q5VV63 1379 aa9.32□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 ESYT2A0FGR8 921 aa9.32□□□□□ -0.92
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PDE4D-208ENST00000502484 CACNB3P54284 484 aa9.32□□□□□ -0.92
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PDE4D-208ENST00000502484 ISM2Q6H9L7 571 aa9.32□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa9.32□□□□□ -0.92
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PDE4D-208ENST00000502484 CLEC10AQ8IUN9 316 aa9.32□□□□□ -0.92
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PDE4D-208ENST00000502484 MAN1B1Q9UKM7 699 aa9.32□□□□□ -0.92
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PDE4D-208ENST00000502484 SMCO2A6NFE2 343 aa9.32□□□□□ -0.92
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PDE4D-208ENST00000502484 RAD17O75943 681 aa9.32□□□□□ -0.92
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PDE4D-208ENST00000502484 LONP1P36776 959 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
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PDE4D-208ENST00000502484 TCP10Q12799 353 aa9.32□□□□□ -0.92
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PDE4D-208ENST00000502484 TATDN1Q6P1N9 297 aa9.32□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa9.32□□□□□ -0.92
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC186Q7Z3E2 898 aa9.32□□□□□ -0.92
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