RNA–Protein interactions for RNA: YOR054C

VHS3, Transcript of Negative regulatory subunit of protein phosphatase 1 Ppz1p, yeast

Gene VHS3, Length 2,025 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VHS3	YOR054C	RRD2	Q12461	358 aa		4.1	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	MET17	P06106	444 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	CBS2	P14905	389 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	COQ1	P18900	473 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	CPR3	P25719	182 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	SPR1	P32603	445 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	PEX2	P32800	271 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	PPQ1	P32945	549 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	AFR1	P33304	620 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	CPR5	P35176	225 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	MAL31	P38156	614 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	MGE1	P38523	228 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	LEU5	P38702	357 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	YHR045W	P38775	560 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	SMF2	P38778	549 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	ATG7	P38862	630 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	FAA2	P39518	744 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	KRE29	P40026	464 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	HPM1	P40481	377 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	THI6	P41835	540 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	YGR153W	P48238	217 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	YGR117C	P53270	476 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	ADI1	Q03677	179 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	AGE1	Q04412	482 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	NUT2	Q06213	157 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	ARV1	Q06541	321 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	YOR214C	Q12282	236 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	YRM1	Q12340	786 aa		4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
VHS3	YOR054C	FOB1	O13329	566 aa		4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	COX4	P04037	155 aa		4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	PMA2	P19657	947 aa		4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	KAR4	P25583	335 aa		4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	CYM1	P32898	989 aa		4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	POP4	P38336	279 aa		4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	SPL2	P38839	148 aa		4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	PES4	P39684	611 aa		4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	PHM8	P40025	321 aa		4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	PSY2	P40164	858 aa		4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	YMR134W	P40207	237 aa		4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	COS4	P43542	379 aa		4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	MAD3	P47074	515 aa		4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	RSM26	P47141	266 aa		4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	EFM3	P47163	339 aa		4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	DAM1	P53267	343 aa		4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	COS1	P53822	381 aa		4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	GOR1	P53839	350 aa		4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	RSN1	Q03516	953 aa		4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	YDR249C	Q03787	373 aa		4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	ADY4	Q05955	493 aa		4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	REH1	Q06709	432 aa		4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	YPR084W	Q06821	456 aa		4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	RSB1	Q08417	382 aa		4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	FEX2	Q08991	375 aa		4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	YDR061W	Q12298	539 aa		4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	RRI2	Q12348	645 aa		4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	AVL9	Q12500	764 aa		4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	FRT1	Q99332	602 aa		4.09	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	GAL1	P04385	528 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	GAL10	P04397	699 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	STE12	P13574	688 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	PMS1	P14242	873 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	DIT1	P21623	536 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	MGT1	P26188	188 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	SEC61	P32915	480 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	YAT2	P40017	923 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	QDR1	P40475	563 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	CHS6	P40955	746 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	RTS2	P40962	232 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	CNN1	P43618	361 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	GUF1	P46943	645 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	ACF4	P47129	309 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	ORC5	P50874	479 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	YGL138C	P53122	345 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	TEP1	P53916	434 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	ACS1	Q01574	713 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	SND1	Q04007	877 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	SEG1	Q04279	960 aa		4.08	□□□□□ -1.76
VHS3	YOR054C	CRR1	Q05790	422 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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