RNA–Protein interactions for RNA: YLL017W

YLL017W, Transcript of Non-essential Ras guanine nucleotide exchange factor (GEF), yeastyeast

Gene YLL017W, Length 312 nt, Biotype pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL017WYLL017W OCT1P35999 772 aa5.29□□□□□ -1.56
YLL017WYLL017W SNU114P36048 1008 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
YLL017WYLL017W ARN1P38731 627 aa5.29□□□□□ -1.56
YLL017WYLL017W NPR2P39923 615 aa5.29□□□□□ -1.56
YLL017WYLL017W SMC3P47037 1230 aa5.29□□□□□ -1.56
YLL017WYLL017W MRX6P48564 524 aa5.29□□□□□ -1.56
YLL017WYLL017W LYS4P49367 693 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
YLL017WYLL017W DSD1P53095 428 aa5.29□□□□□ -1.56
YLL017WYLL017W TIM10P87108 93 aa5.29□□□□□ -1.56
YLL017WYLL017W TDA9Q04545 1251 aa5.29□□□□□ -1.56
YLL017WYLL017W MFB1Q04922 465 aa5.29□□□□□ -1.56
YLL017WYLL017W ATG9Q12142 997 aa5.29□□□□□ -1.56
YLL017WYLL017W GET3Q12154 354 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
YLL017WYLL017W TAH18Q12181 623 aa5.29□□□□□ -1.56
YLL017WYLL017W INP53Q12271 1107 aa5.29□□□□□ -1.56
YLL017WYLL017W SPE4Q12455 300 aa5.29□□□□□ -1.56
YLL017WYLL017W BUR6P40096 142 aa5.28□□□□□ -1.56
YLL017WYLL017W YFR020WP43600 232 aa5.28□□□□□ -1.56
YLL017WYLL017W IRC7P43623 340 aa5.28□□□□□ -1.56
YLL017WYLL017W GLO1P50107 326 aa5.28□□□□□ -1.56
YLL017WYLL017W ARP9Q05123 467 aa5.28□□□□□ -1.56
YLL017WYLL017W NDJ1Q12366 352 aa5.28□□□□□ -1.56
YLL017WYLL017W ERG11P10614 530 aa5.27□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W POL4P25615 582 aa5.27□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W YIH1P25637 258 aa5.27□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W UTP9P38882 575 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W RGI2P40188 164 aa5.27□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W YJL107CP42947 387 aa5.27□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W NMD5P46970 1048 aa5.27□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W RPS7BP48164 190 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W YML037CQ03703 340 aa5.27□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W PDR8Q06149 701 aa5.27□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W MCH4Q08268 501 aa5.27□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W YLR049CQ12110 428 aa5.27□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W PGK1P00560 416 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W CHO1P08456 276 aa5.26□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W GPA1P08539 472 aa5.26□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W URE2P23202 354 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W STE50P25344 346 aa5.26□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W OCA4P25366 362 aa5.26□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W ORC2P32833 620 aa5.26□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W YKL050CP35736 922 aa5.26□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W ARF3P40994 183 aaRIP-Chip data5.26□□□□□ -1.57not detected
YLL017WYLL017W RMD8P43620 662 aa5.26□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W DIA3P52290 468 aa5.26□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W EAF7P53911 425 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W IDP3P53982 420 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W BUD22Q04347 519 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W COQ11Q05892 277 aa5.26□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W PIG1Q06216 648 aa5.26□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W YEH1Q07804 573 aa5.26□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W FRE7Q12333 620 aa5.26□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W ARD1P07347 238 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W CBS1P14066 229 aa5.25□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W APN1P22936 367 aa5.25□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W YCR006CP25350 157 aa5.25□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W SAC1P32368 623 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W MPE1P35728 441 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W CUE2P36075 443 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W CCT6P39079 546 aa5.25□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W SNO3P43544 222 aa5.25□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W SGM1P47166 707 aa5.25□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W YGR066CP53242 292 aa5.25□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W MRPL19P53875 158 aa5.25□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W ZDS2P54786 942 aa5.25□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W YMR178WQ03219 274 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W PFA5Q03289 374 aa5.25□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W SCM3Q12334 223 aa5.25□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W YJR112W-AQ3E743 109 aa5.25□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W YNL162W-AQ3E7A8 72 aa5.25□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W RAP1P11938 827 aa5.24□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W SPE2P21182 396 aa5.24□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W COQ3P27680 312 aa5.24□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W PEP3P27801 918 aa5.24□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W MNN2P38069 597 aa5.24□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W EFM6P53970 246 aa5.24□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W RPT6Q01939 405 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W MAK10Q02197 733 aa5.24□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W RSC9Q03124 581 aa5.24□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W SPC19Q03954 165 aa5.24□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W TAF11Q04226 346 aa5.24□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W SWF1Q04629 336 aa5.24□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W ETT1Q08421 412 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W TAD3Q9URQ3 322 aa5.24□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W MF(ALPHA)1P01149 165 aa5.23□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W ARG3P05150 338 aa5.23□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W TKL1P23254 680 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W CLB2P24869 491 aa5.23□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W PGS1P25578 521 aa5.23□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W NPL6P32832 435 aa5.23□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W PXL1P36166 706 aa5.23□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W ATF1P40353 525 aa5.23□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W SPO22P40511 975 aa5.23□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W FAR3P46671 204 aa5.23□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W SEG1Q04279 960 aa5.23□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W FMP40Q08968 688 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W APL4Q12028 832 aa5.23□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W LEU9Q12166 604 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
YLL017WYLL017W YPT6Q99260 215 aa5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 37.7 ms