RNA–Protein interactions for RNA: YKL008C

LAC1, Transcript of Ceramide synthase component, yeast

Gene LAC1, Length 1,257 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LAC1	YKL008C	SKM1	Q12469	655 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	MMS1	Q06211	1407 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	RAP1	P11938	827 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	CHS3	P29465	1165 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	LYS14	P40971	790 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	RAD30	Q04049	632 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	SWF1	Q04629	336 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	YOL159C	Q08300	171 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	GEP3	Q08622	556 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	STE50	P25344	346 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	GAT1	P43574	510 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	VPS25	P47142	202 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	AAD10	P47182	288 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	ASI1	P54074	624 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	VTC3	Q02725	835 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	YDL121C	Q07541	149 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	YDR056C	Q12025	205 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	YLR112W	Q12130	139 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	RGT2	Q12300	763 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	NKP1	Q12493	238 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	YOR111W	Q99210	232 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	BUR6	P40096	142 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	PCI8	P40512	444 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	YTP1	P53584	459 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	YSA1	Q01976	231 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	ATX2	Q12067	313 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	CDC25	P04821	1589 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	CDC16	P09798	840 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	PRE8	P23639	250 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	YIR016W	P40572	265 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	NNF2	P53253	936 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	ATG9	Q12142	997 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LAC1	YKL008C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
LAC1	YKL008C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	MGM1	P32266	881 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	ASK1	P35734	292 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	RTS1	P38903	757 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	PKP1	P40530	394 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	INA17	Q02888	182 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	POS5	Q06892	414 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	PSR1	Q07800	427 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	ENT1	Q12518	454 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	MAL33	P38157	468 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	SPC97	P38863	823 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	VRG4	P40107	337 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	MDV1	P47025	714 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	IZH1	Q03419	316 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	CAC2	Q04199	468 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	GSH2	Q08220	491 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	TCO89	Q08921	799 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	INP53	Q12271	1107 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	ICT1	Q12385	394 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	SGS1	P35187	1447 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	SAN1	P22470	610 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	PAH1	P32567	862 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	TMT1	P32643	299 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	MNN2	P38069	597 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	SGF73	P53165	657 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	YKU80	Q04437	629 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	YAP7	Q08182	245 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	IRC20	Q06554	1556 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	AAC3	P18238	307 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	YCK1	P23291	538 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	CLB2	P24869	491 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	TMA108	P40462	946 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	SEC5	P89102	971 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	MCP2	Q06567	569 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LAC1	YKL008C	CBP1	P07252	654 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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