RNA–Protein interactions for RNA: YHR197W

RIX1, Transcript of Component of the Rix1 complex and possibly pre-replicative complexes, yeast

Gene RIX1, Length 2,292 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIX1	YHR197W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	GRR1	P24814	1151 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	RML2	P32611	393 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	MRP4	P32902	394 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	MSN4	P33749	630 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	PMT1	P33775	817 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	SAP190	P36123	1033 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	YKR075C	P36155	307 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	YHR033W	P38690	423 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	YNL195C	P40168	261 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	DOT5	P40553	215 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	MAK10	Q02197	733 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	STE23	Q06010	1027 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	BOP2	Q06150	570 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	HOS1	Q12214	470 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	SAM35	P14693	329 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	GEX1	P25596	615 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	APN2	P38207	520 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	SLM4	P38247	162 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	TOS1	P38288	455 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	FTR1	P40088	404 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	AIM20	P40451	204 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	BIT61	P47041	543 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	ASE1	P50275	885 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	COS12	P53053	380 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	VID30	P53076	958 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	PIB2	P53191	635 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	KAP120	Q02932	1032 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	INP2	Q03824	705 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	SEG1	Q04279	960 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	YPR196W	Q06595	470 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	MDM36	Q06820	579 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.98	□□□□□ -1.93	not detected
RIX1	YHR197W	CMC1	P36064	111 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	ATG14	P38270	344 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	COS111	P38308	924 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	YHL017W	P38745	532 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	MMM1	P41800	426 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	CTK2	P46962	323 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	TIM21	P53220	239 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	SMA1	Q02651	245 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	SMA2	Q04658	369 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	ECM7	Q06200	448 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	CDA1	Q06702	301 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	NDJ1	Q12366	352 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	GAL7	P08431	366 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	YML003W	P0CF16	290 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	RPC37	P36121	282 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	MNN2	P38069	597 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	MAL33	P38157	468 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	REG2	P38232	338 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	MSG5	P38590	489 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	ERC1	P38767	581 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	CTF8	P38877	133 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	REV7	P38927	245 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	VFA1	P40080	203 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	YIL089W	P40500	205 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	YIR014W	P40570	242 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	SSY5	P47002	699 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	ZAP1	P47043	880 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	PET130	P47065	347 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	NCS6	P53088	359 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	YGR066C	P53242	292 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	ATG21	Q02887	496 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	ARR1	Q06596	294 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	LDB17	Q12342	491 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	SEC39	Q12745	709 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	VPS63	O13549	108 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	CYC7	P00045	113 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	TUP1	P16649	713 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	CLC1	P17891	233 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RIX1	YHR197W	URK1	P27515	501 aa		2.97	□□□□□ -1.93

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