RNA–Protein interactions for RNA: YHR016C

YSC84, Transcript of Actin-binding protein, yeast

Gene YSC84, Length 1,407 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YSC84	YHR016C	FAA2	P39518	744 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	AIM20	P40451	204 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	AGP3	P43548	558 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	YJR154W	P47181	346 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	YNL033W	P53964	284 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	YNL019C	P53975	284 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	YDR131C	Q03899	556 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	RMD5	Q12508	421 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	AFI1	Q99222	893 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	HSF1	P10961	833 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	UGA1	P17649	471 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	CCA1	P21269	546 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	PTH2	P34222	208 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	YBR285W	P38354	144 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	FHL1	P39521	936 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	DIA3	P52290	468 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	PEX8	P53248	589 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	ECM9	Q02202	377 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	CRN1	Q06440	651 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	ULA1	Q12059	462 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	TRP3	P00937	484 aa		11.68	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	CIT2	P08679	460 aa		11.68	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.68	□□□□□ -0.54	not detected
YSC84	YHR016C	PMA2	P19657	947 aa		11.68	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	RAD27	P26793	382 aa		11.68	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	PTP2	P29461	750 aa		11.68	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	MUP3	P38734	546 aa		11.68	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	HAT2	P39984	401 aa		11.68	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	ESL1	P40456	1118 aa		11.68	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	IMA5	P40884	581 aa		11.68	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	RMR1	P53060	241 aa		11.68	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	TIM13	P53299	105 aa		11.68	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	CDC14	Q00684	551 aa		11.68	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	YDR239C	Q03780	787 aa		11.68	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	YLR413W	Q06689	675 aa		11.68	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	SAS5	Q99314	248 aa		11.68	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	DSS1	P39112	969 aa		11.67	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	YEN1	P40028	759 aa		11.67	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	GTR2	P53290	341 aa		11.67	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	PET117	Q02771	107 aa		11.67	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	YDR109C	Q04585	715 aa		11.67	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	YCS4	Q06156	1176 aa		11.67	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	PMT7	Q06644	662 aa		11.67	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	YDL121C	Q07541	149 aa		11.67	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	SGT1	Q08446	395 aa		11.67	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	IES3	Q12345	250 aa		11.67	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	ABF1	P14164	731 aa		11.66	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	PHO81	P17442	1178 aa		11.66	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	PTM1	P32857	523 aa		11.66	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	SKG1	P36169	355 aa		11.66	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	YBR241C	P38142	488 aa		11.66	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	YBR138C	P38277	524 aa		11.66	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	MSC7	P38694	644 aa		11.66	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	YIR007W	P40566	764 aa		11.66	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	ARH1	P48360	493 aa		11.66	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	SHE4	P51534	789 aa		11.66	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	BOL2	P53082	120 aa		11.66	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	YGR053C	P53234	283 aa		11.66	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	FMP42	Q04991	504 aa		11.66	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	YVC1	Q12324	675 aa		11.66	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	VCX1	Q99385	411 aa		11.66	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	CLB2	P24869	491 aa		11.65	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	BIO2	P32451	375 aa		11.65	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	TOM20	P35180	183 aa		11.65	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	SLX1	P38324	304 aa		11.65	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	SFB3	P38810	929 aa		11.65	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	RTT101	P47050	842 aa		11.65	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	NUP100	Q02629	959 aa		11.65	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	LOT6	Q07923	191 aa		11.65	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	YOL159C	Q08300	171 aa		11.65	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	HEM2	P05373	342 aa		11.64	□□□□□ -0.55
YSC84	YHR016C	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
YSC84	YHR016C	CLN1	P20437	546 aa		11.64	□□□□□ -0.55
YSC84	YHR016C	POL4	P25615	582 aa		11.64	□□□□□ -0.55
YSC84	YHR016C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
YSC84	YHR016C	KAR9	P32526	644 aa		11.64	□□□□□ -0.55
YSC84	YHR016C	DSS4	P32601	143 aa		11.64	□□□□□ -0.55
YSC84	YHR016C	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
YSC84	YHR016C	FRE2	P36033	711 aa		11.64	□□□□□ -0.55
YSC84	YHR016C	ROT2	P38138	954 aa		11.64	□□□□□ -0.55
YSC84	YHR016C	GOS1	P38736	223 aa		11.64	□□□□□ -0.55
YSC84	YHR016C	GIP4	P39732	760 aa		11.64	□□□□□ -0.55
YSC84	YHR016C	SLX8	P40072	274 aa		11.64	□□□□□ -0.55
YSC84	YHR016C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55

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