RNA–Protein interactions for RNA: YER190W

YRF1-2, Transcript of Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, yeastyeast

Gene YRF1-2, Length 5,046 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-2YER190W YHR035WP38769 630 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W GIC1P38785 314 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W TIM54P47045 478 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W IMD3P50095 523 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W SVS1Q12254 260 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W MDM12Q92328 271 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W AI5_BETAQ9ZZX0 354 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W APC1P53886 1748 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W POL4P25615 582 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W DPH2P32461 534 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W PFK26P40433 827 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W NHX1Q04121 633 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W FCF2Q12035 217 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W SIR3P06701 978 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W VBA3P25594 458 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W SSO1P32867 290 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W VBA5P36172 582 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W MRPL40P36534 297 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W APE3P37302 537 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W ARA1P38115 344 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W ATG14P38270 344 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W SPL2P38839 148 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W YEN1P40028 759 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W YGL041W-AP0C5N3 154 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W PDX3P38075 228 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W KAP104P38217 918 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W ECM10P39987 644 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W DSE1P40077 573 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W DDI1P40087 428 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W CAF120P53836 1060 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W YNL033WP53964 284 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W YNL019CP53975 284 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W DDC1Q08949 612 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W RTR2Q12378 196 aa8.36□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W ADE3P07245 946 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W ESS1P22696 170 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W MTW1P39731 289 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W SYG1P40528 902 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W BNA3P47039 444 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W HEH2Q03281 663 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W PUT4P15380 627 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W SKT5P34226 696 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W MCR1P36060 302 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W YRB2P40517 327 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W MND2P40577 368 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W SKP2P42843 763 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W YMR074CQ04773 145 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W RSC2Q06488 889 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W TEF1P02994 458 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W MRPL32P25348 183 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W CDC27P38042 758 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W GPB2P39717 880 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W YNL146WP53906 100 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W ABF1P14164 731 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W YSP3P25036 478 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W LCB2P40970 561 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W SPO71Q03868 1245 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W APC9Q12107 265 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W STB3Q12427 513 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W SUS1Q6WNK7 96 aa8.35□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W PEP4P07267 405 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W RAP1P11938 827 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W ATP12P22135 325 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W UGP1P32861 499 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W YBL086CP38177 466 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W MMS21P38632 267 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W NUP49Q02199 472 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W IES4Q08561 116 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W PUS7Q08647 676 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W BI4P03879 638 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W SNF3P10870 884 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W BEM1P29366 551 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W YRO2P38079 344 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W MLH1P38920 769 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W TAH11P47112 604 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W SLD3P53135 668 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W YPL107WQ02873 248 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W SPH1Q06160 661 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W TIM9O74700 87 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W SGF29P25554 259 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W AAR2P32357 355 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W PXA2P34230 853 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W ANR2P36090 516 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W AVT2P39981 480 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W TPA1P40032 644 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W SER33P40510 469 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W ORC5P50874 479 aa8.34□□□□□ -1.07
YRF1-2YER190W PMA2P19657 947 aa8.34□□□□□ -1.08
YRF1-2YER190W ADY2P25613 283 aa8.34□□□□□ -1.08
YRF1-2YER190W YFR018CP43599 363 aa8.34□□□□□ -1.08
YRF1-2YER190W YMR155WQ03795 547 aa8.34□□□□□ -1.08
YRF1-2YER190W BSC2Q05611 235 aa8.34□□□□□ -1.08
YRF1-2YER190W RIB2Q12362 591 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.08
YRF1-2YER190W BBP1Q12365 385 aa8.34□□□□□ -1.08
YRF1-2YER190W IMA3P0CW40 589 aa8.33□□□□□ -1.08
YRF1-2YER190W IMA4P0CW41 589 aa8.33□□□□□ -1.08
YRF1-2YER190W PPZ1P26570 692 aa8.33□□□□□ -1.08
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