RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	RMP1	Q12530	201 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	VPS5	Q92331	675 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	BI2	P03873	423 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	FRE1	P32791	686 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	HEL1	P36113	551 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	FUI1	P38196	639 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	TVP23	P38962	199 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	ECM1	P39715	212 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	RAD26	P40352	1085 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	TMA108	P40462	946 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	POL31	P46957	487 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	PCL10	P53124	433 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	PEX31	P53203	462 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	SND1	Q04007	877 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	ARO80	Q04052	950 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	TAF9	Q05027	157 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	GRX8	Q05926	109 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.72	□□□□□ -1.65	not detected
CPR4	YCR069W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CPR4	YCR069W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	YME1	P32795	747 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	CSE2	P33308	149 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	TKL2	P33315	681 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.71	□□□□□ -1.66	not detected
CPR4	YCR069W	TDP1	P38319	544 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	END3	P39013	349 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	TMN3	P40071	706 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	SAP185	P40856	1058 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	TCB2	P48231	1178 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	MRX6	P48564	524 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	SPC98	P53540	846 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	ADA2	Q02336	434 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	THI7	Q05998	598 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	GPM2	Q12008	311 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	NBP2	Q12163	236 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	YLR149C	Q99296	730 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	PEP5	P12868	1029 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	SPO16	P17122	198 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	CDC43	P18898	376 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	KIN3	P22209	435 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	SYN8	P31377	255 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	CCL1	P37366	393 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	POP4	P38336	279 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	JHD1	P40034	492 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	ASG1	P40467	964 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	YFL052W	P43551	465 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	BNA2	P47125	453 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	YML6	P51998	286 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	URH1	Q04179	340 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	THI20	Q08224	551 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	CDC9	P04819	755 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	YML002W	P0CF17	737 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	ADH4	P10127	382 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	SRB2	P34162	210 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	YHR112C	P38716	378 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	REV7	P38927	245 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	PRM9	P39551	298 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	YMR134W	P40207	237 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	INA22	P40576	216 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	OPT1	P40897	799 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	YJL132W	P47014	750 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	BRO1	P48582	844 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	MET13	P53128	600 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	MTL1	P53214	551 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	SHR3	Q02774	210 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	MUB1	Q03162	620 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	UFO1	Q04511	668 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	AIM32	Q04689	311 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	PRM6	Q04705	352 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CPR4	YCR069W	CDD1	Q06549	142 aa		4.69	□□□□□ -1.66

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