RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	FLC3	P53121	802 aa		10.91	□□□□□ -0.66
DDR2	YOL052C-A	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	10.91	□□□□□ -0.66
DDR2	YOL052C-A	YMR155W	Q03795	547 aa		10.91	□□□□□ -0.66
DDR2	YOL052C-A	SGO1	Q08490	590 aa		10.91	□□□□□ -0.66
DDR2	YOL052C-A	YOR338W	Q99326	363 aa		10.91	□□□□□ -0.66
DDR2	YOL052C-A	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	10.9	□□□□□ -0.66
DDR2	YOL052C-A	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	10.9	□□□□□ -0.66
DDR2	YOL052C-A	PMA2	P19657	947 aa		10.9	□□□□□ -0.66
DDR2	YOL052C-A	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	10.9	□□□□□ -0.66
DDR2	YOL052C-A	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	10.9	□□□□□ -0.66
DDR2	YOL052C-A	YSC84	P32793	468 aa		10.9	□□□□□ -0.66
DDR2	YOL052C-A	STB6	P36085	766 aa		10.9	□□□□□ -0.66
DDR2	YOL052C-A	LDB7	P38210	180 aa		10.9	□□□□□ -0.66
DDR2	YOL052C-A	PAN6	P40459	309 aa		10.9	□□□□□ -0.66
DDR2	YOL052C-A	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	10.9	□□□□□ -0.66
DDR2	YOL052C-A	GYP8	P43570	497 aa		10.9	□□□□□ -0.66
DDR2	YOL052C-A	CSN12	P47130	423 aa		10.9	□□□□□ -0.66
DDR2	YOL052C-A	YJR124C	P47159	448 aa		10.9	□□□□□ -0.66
DDR2	YOL052C-A	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	10.9	□□□□□ -0.66
DDR2	YOL052C-A	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	10.9	□□□□□ -0.66
DDR2	YOL052C-A	NHP10	Q03435	203 aa		10.9	□□□□□ -0.66
DDR2	YOL052C-A	CSN9	Q03981	162 aa		10.9	□□□□□ -0.66
DDR2	YOL052C-A	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	10.9	□□□□□ -0.66
DDR2	YOL052C-A	NUS1	Q12063	375 aa		10.9	□□□□□ -0.66
DDR2	YOL052C-A	PER33	Q12144	273 aa		10.9	□□□□□ -0.66
DDR2	YOL052C-A	YOL087C	Q99247	1116 aa		10.9	□□□□□ -0.66
DDR2	YOL052C-A	COX6	P00427	148 aa		10.89	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	EXO70	P19658	623 aa		10.89	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	YCR099C	P25657	155 aa		10.89	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		10.89	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	TOA1	P32773	286 aa		10.89	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	SCD5	P34758	872 aa		10.89	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	CTP1	P38152	299 aa		10.89	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	NEM1	P38757	446 aa		10.89	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	YDR089W	P38966	869 aa		10.89	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	RPH1	P39956	796 aa		10.89	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	AXL1	P40851	1208 aa		10.89	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	CHS6	P40955	746 aa		10.89	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	BOL2	P53082	120 aa		10.89	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	MRM2	P53123	320 aa		10.89	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	SPC105	P53148	917 aa		10.89	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	YNR065C	P53751	1116 aa		10.89	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	YNL143C	P53908	130 aa		10.89	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	MPH2	P0CD99	609 aa		10.88	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	ARG1	P22768	420 aa		10.88	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	VAC17	P25591	423 aa		10.88	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	ASK1	P35734	292 aa		10.88	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	RRN3	P36070	627 aa		10.88	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	GTS1	P40956	396 aa		10.88	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	FMN1	Q03778	218 aa		10.88	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	YDR131C	Q03899	556 aa		10.88	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	APC9	Q12107	265 aa		10.88	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	MDY2	Q12285	212 aa		10.88	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	CCH1	P50077	2039 aa		10.87	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	RHO2	P06781	192 aa		10.87	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	PMR1	P13586	950 aa		10.87	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	NPP1	P25353	742 aa		10.87	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	SWE1	P32944	819 aa		10.87	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	PXA2	P34230	853 aa		10.87	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	MUP3	P38734	546 aa		10.87	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	ERP5	P38819	212 aa		10.87	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	IME4	P41833	600 aa		10.87	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	GLG2	P47011	380 aa		10.87	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	VEL1	P53058	206 aa		10.87	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	MNT2	P53059	558 aa		10.87	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	GTR1	Q00582	310 aa		10.87	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	PPN1	Q04119	674 aa		10.87	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	YDR338C	Q05497	695 aa		10.87	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	BLS1	Q06071	122 aa		10.87	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	SEC10	Q06245	871 aa		10.87	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	RSB1	Q08417	382 aa		10.87	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	TGL5	Q12043	749 aa		10.87	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	YPR089W	O13585	888 aa		10.86	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	STE13	P33894	931 aa		10.86	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	PHO11	P35842	467 aa		10.86	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	RFC3	P38629	340 aa		10.86	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	PHO12	P38693	467 aa		10.86	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	BZZ1	P38822	633 aa		10.86	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	STN1	P38960	494 aa		10.86	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	OSW5	P40219	148 aa		10.86	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	SFB2	P53953	876 aa		10.86	□□□□□ -0.67
DDR2	YOL052C-A	UBP2	Q01476	1272 aa		10.86	□□□□□ -0.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.6 ms