RNA–Protein interactions for RNA: YNL208W

YNL208W, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YNL208W, Length 600 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL208W	YNL208W	KEX2	P13134	814 aa		13.87	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	PPZ1	P26570	692 aa		13.87	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	STE5	P32917	917 aa		13.87	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	STE13	P33894	931 aa		13.87	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	LDB7	P38210	180 aa		13.87	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	YHR131C	P38835	850 aa		13.87	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	MRX1	P40050	688 aa		13.87	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	ALG8	P40351	577 aa		13.87	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	MNT2	P53059	558 aa		13.87	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	NUT2	Q06213	157 aa		13.87	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	RMD5	Q12508	421 aa		13.87	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	YOR338W	Q99326	363 aa		13.87	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	FRT1	Q99332	602 aa		13.87	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	HIS5	P07172	385 aa		13.86	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	GUT2	P32191	649 aa		13.86	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	YKL097C	P34245	136 aa		13.86	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	HSM3	P38348	480 aa		13.86	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	TEL2	P53038	688 aa		13.86	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	VPS16	Q03308	798 aa		13.86	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	NUS1	Q12063	375 aa		13.86	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	YMR085W	P0CF18	432 aa		13.85	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	ABF1	P14164	731 aa		13.85	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	STB6	P36085	766 aa		13.85	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.85	□□□□□ -0.19	not detected
YNL208W	YNL208W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	OSW5	P40219	148 aa		13.85	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	RMD8	P43620	662 aa		13.85	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	CSN9	Q03981	162 aa		13.85	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	PPN1	Q04119	674 aa		13.85	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	YPR117W	Q06116	2489 aa		13.84	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	STE2	D6VTK4	431 aa		13.84	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	YCR099C	P25657	155 aa		13.84	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	YJU3	P28321	313 aa		13.84	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		13.84	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	SPP2	Q02521	185 aa		13.84	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	TGL5	Q12043	749 aa		13.84	□□□□□ -0.19
YNL208W	YNL208W	COX6	P00427	148 aa		13.83	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	RRN3	P36070	627 aa		13.83	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	RPH1	P39956	796 aa		13.83	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	GTS1	P40956	396 aa		13.83	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	IME4	P41833	600 aa		13.83	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	GLG2	P47011	380 aa		13.83	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	PET130	P47065	347 aa		13.83	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	NHP10	Q03435	203 aa		13.83	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	NSE1	Q07913	336 aa		13.83	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	YPT6	Q99260	215 aa		13.83	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	MSF1	P08425	469 aa		13.82	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	BAS1	P22035	811 aa		13.82	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	MRM1	P25270	412 aa		13.82	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	YSC84	P32793	468 aa		13.82	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	YKR023W	P36119	530 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	YBR259W	P38338	688 aa		13.82	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	ATH1	P48016	1211 aa		13.82	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	EMC4	P53073	190 aa		13.82	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	BOL2	P53082	120 aa		13.82	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	VAC7	P53950	1165 aa		13.82	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	FUS1	P11710	512 aa		13.81	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	CLB1	P24868	471 aa		13.81	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	ASK1	P35734	292 aa		13.81	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	PHO11	P35842	467 aa		13.81	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	PHO12	P38693	467 aa		13.81	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	STN1	P38960	494 aa		13.81	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	AXL1	P40851	1208 aa		13.81	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	MAD3	P47074	515 aa		13.81	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	YMR155W	Q03795	547 aa		13.81	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	TVP15	Q03860	143 aa		13.81	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	YDR131C	Q03899	556 aa		13.81	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	MDY2	Q12285	212 aa		13.81	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	MGS1	P40151	587 aa		13.8	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	CIA1	Q05583	330 aa		13.8	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	SEC10	Q06245	871 aa		13.8	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	CRN1	Q06440	651 aa		13.8	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	APC9	Q12107	265 aa		13.8	□□□□□ -0.2
YNL208W	YNL208W	UBX3	Q12229	455 aa		13.8	□□□□□ -0.2

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 40.9 ms