RNA–Protein interactions for RNA: YLR117C

CLF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene CLF1, Length 2,064 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLF1	YLR117C	HIS2	P38635	335 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	LEU5	P38702	357 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	DSS1	P39112	969 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	AIM2	P39721	246 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	RTT105	P40063	208 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	HXT8	P40886	569 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	RTT101	P47050	842 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	PIP2	P52960	996 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	OKP1	P53298	406 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	RMI1	Q02685	241 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YMR279C	Q03263	540 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YET2	Q04210	160 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YLR297W	Q05899	129 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
CLF1	YLR117C	YNG1	Q08465	219 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	GAL10	P04397	699 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	MET17	P06106	444 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	TPK2	P06245	380 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	CBS2	P14905	389 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	PHO81	P17442	1178 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	DIT1	P21623	536 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	CNB1	P25296	175 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	CCL1	P37366	393 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YHR202W	P38887	602 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	SEN34	P39707	275 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	PHM8	P40025	321 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YRB2	P40517	327 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	IRC8	P47046	822 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YGR111W	P53265	400 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YNL193W	P53870	558 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	HXT15	P54854	567 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	RPN4	Q03465	531 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YDR514C	Q04408	483 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	CRR1	Q05790	422 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	TFC6	Q06339	672 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	PSY3	Q12318	242 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	KIN1	P13185	1064 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	SFL1	P20134	766 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	SPR1	P32603	445 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YKL133C	P36066	463 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	MCM7	P38132	845 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	ECM13	P38195	257 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	EXO1	P39875	702 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	SOK1	P40317	901 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	NUP82	P40368	713 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	THI6	P41835	540 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	TOS3	P43637	560 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.79	□□□□□ -1.64	not detected
CLF1	YLR117C	YGR067C	P53243	804 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	REC102	Q02721	264 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	RSN1	Q03516	953 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	SCS7	Q03529	384 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	ADI1	Q03677	179 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	PPM2	Q08282	695 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	RSB1	Q08417	382 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	RIM15	P43565	1770 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	HTA2	P04912	132 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.78	□□□□□ -1.64	RIP-Chip
CLF1	YLR117C	PRI2	P20457	528 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	ATG22	P25568	528 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	KAR4	P25583	335 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	DBF20	P32328	564 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YBL036C	P38197	257 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	CDS1	P38221	457 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	CCZ1	P38273	704 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	UBP5	P39944	805 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	SLX8	P40072	274 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	HPM1	P40481	377 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	VHR1	P40522	640 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	AGE2	P40529	298 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	GTT1	P40582	234 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	GUF1	P46943	645 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	AIM24	P47127	394 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	EFM3	P47163	339 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	ORC5	P50874	479 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	COG1	P53079	417 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	YGR125W	P53273	1036 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	BIO4	P53630	237 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	TEP1	P53916	434 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CLF1	YLR117C	HDA1	P53973	706 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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