RNA–Protein interactions for RNA: YHR016C

YSC84, Transcript of Actin-binding protein, yeast

Gene YSC84, Length 1,407 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YSC84	YHR016C	CNA1	P23287	553 aa		11.75	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	CSM1	P25651	190 aa		11.75	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	ATP7	P30902	174 aa		11.75	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	RIM11	P38615	370 aa		11.75	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	RAD55	P38953	406 aa		11.75	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	CDC1	P40986	491 aa		11.75	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	HSP31	Q04432	237 aa		11.75	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	YPL247C	Q12523	523 aa		11.75	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	SNF4	P12904	322 aa		11.74	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	YIH1	P25637	258 aa		11.74	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	XDJ1	P39102	459 aa		11.74	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	SEO1	P39709	593 aa		11.74	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	SWC7	Q06707	132 aa		11.74	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	VIK1	Q12045	647 aa		11.74	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	NSL1	Q12143	216 aa		11.74	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	MDY2	Q12285	212 aa		11.74	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	ATG34	Q12292	412 aa		11.74	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	VPS13	Q07878	3144 aa		11.73	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	COX5A	P00424	153 aa		11.73	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	CCP1	P00431	361 aa		11.73	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	CSE1	P33307	960 aa		11.73	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	TKL2	P33315	681 aa		11.73	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	MRP21	P38175	177 aa		11.73	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	YHL026C	P38740	315 aa		11.73	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	BRL1	P38770	471 aa		11.73	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	ECM10	P39987	644 aa		11.73	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	MRK1	P50873	501 aa		11.73	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	IMA1	P53051	589 aa		11.73	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	SPC98	P53540	846 aa		11.73	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	SIW14	P53965	281 aa		11.73	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	ASI1	P54074	624 aa		11.73	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	TRS31	Q03337	283 aa		11.73	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	RAD30	Q04049	632 aa		11.73	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	MUM3	Q08750	479 aa		11.73	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	GPM2	Q12008	311 aa		11.73	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	PSY3	Q12318	242 aa		11.73	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	ARP7	Q12406	477 aa		11.73	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	TAO3	P40468	2376 aa		11.72	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	SEM1	O94742	89 aa		11.72	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	SPC42	P36094	363 aa		11.72	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	ELO3	P40319	345 aa		11.72	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	COA1	P40452	197 aa		11.72	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	GMC2	Q06201	188 aa		11.72	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	NTO1	Q12311	748 aa		11.72	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	TPK2	P06245	380 aa		11.71	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	COR1	P07256	457 aa		11.71	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	MSS18	P08593	268 aa		11.71	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	PEP12	P32854	288 aa		11.71	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	SEC66	P33754	206 aa		11.71	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	PEX6	P33760	1030 aa		11.71	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	POA1	P38218	177 aa		11.71	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	IST2	P38250	946 aa		11.71	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	TDP1	P38319	544 aa		11.71	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	VHR1	P40522	640 aa		11.71	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	CNN1	P43618	361 aa		11.71	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	SNG1	P46950	547 aa		11.71	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	YGR035C	P53222	116 aa		11.71	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	GPI1	P53306	609 aa		11.71	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	RMI1	Q02685	241 aa		11.71	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	GAS3	Q03655	524 aa		11.71	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	SMP3	Q04174	516 aa		11.71	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	MSH5	Q12175	901 aa		11.71	□□□□□ -0.53
YSC84	YHR016C	PHO91	P27514	894 aa		11.7	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	BEM1	P29366	551 aa		11.7	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	NGG1	P32494	702 aa		11.7	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	MDJ1	P35191	511 aa		11.7	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	MRP8	P35719	219 aa		11.7	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	YBL029W	P38201	376 aa		11.7	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	CYC2	P38909	366 aa		11.7	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	SPO74	P45819	413 aa		11.7	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	UBX3	Q12229	455 aa		11.7	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	YSP3	P25036	478 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	PHO87	P25360	923 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	NPL6	P32832	435 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	CSE2	P33308	149 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	FUI1	P38196	639 aa		11.69	□□□□□ -0.54
YSC84	YHR016C	YHR131C	P38835	850 aa		11.69	□□□□□ -0.54

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