RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		7.76	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	7.76	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	MEIS3	Q99687	375 aa		7.76	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	7.76	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	USP44	Q9H0E7	712 aa		7.76	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	7.76	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	PARP2	Q9UGN5	583 aa		7.76	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	7.76	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	RREB1	Q92766	1687 aa		7.76	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		7.76	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPS6KA4	O75676	772 aa		7.75	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	STARD3NL	O95772	234 aa		7.75	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHD	P01880	384 aa		7.75	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	EDN3	P14138	238 aa		7.75	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	IRS1	P35568	1242 aa		7.75	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	7.75	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	CASP7	P55210	303 aa		7.75	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCSK7	Q16549	785 aa		7.75	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	SYNE4	Q8N205	404 aa		7.75	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		7.75	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	KAZALD1	Q96I82	304 aa		7.75	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		7.75	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	7.75	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		7.75	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	7.75	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1W2PP55	124 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	NFKBIE	O00221	500 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLURP2	P0DP57	97 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	7.74	□□□□□ -1.17	9e-54	■■■■■ 28.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	PI16	Q6UXB8	463 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	SKAP1	Q86WV1	359 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	MYD88	Q99836	296 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	GGA1	Q9UJY5	639 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		7.74	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	LY75	O60449	1722 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATP10D	Q9P241	1426 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	GIPC1	O14908	333 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADH7	P40394	386 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	ELOA3	Q8NG57	546 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	ACD	Q96AP0	544 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	NAGPA	Q9UK23	515 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	UTY	O14607	1347 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		7.73	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	7.72	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	WFS1	O76024	890 aa		7.72	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	ACPP	P15309	386 aa		7.72	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	GMPR	P36959	345 aa		7.72	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	TCIRG1	Q13488	830 aa		7.72	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	GCKR	Q14397	625 aa		7.72	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	7.72	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	7.72	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	7.72	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		7.72	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINS1	Q8NG48	757 aa		7.72	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	SUCLG2	Q96I99	432 aa		7.72	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		7.72	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		7.72	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		7.72	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	AK5	Q9Y6K8	562 aa		7.72	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		7.72	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	COL15A1	P39059	1388 aa		7.71	□□□□□ -1.17
RABGGTB-212	ENST00000491266	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		7.71	□□□□□ -1.18
RABGGTB-212	ENST00000491266	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		7.71	□□□□□ -1.18
RABGGTB-212	ENST00000491266	ALDH1L1	O75891	902 aa		7.71	□□□□□ -1.18
RABGGTB-212	ENST00000491266	RECK	O95980	971 aa		7.71	□□□□□ -1.18
RABGGTB-212	ENST00000491266	EPX	P11678	715 aa		7.71	□□□□□ -1.18
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPT	P24298	496 aa		7.71	□□□□□ -1.18
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
RABGGTB-212	ENST00000491266	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	7.71	□□□□□ -1.18
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18

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