RNA–Protein interactions for RNA: tS(GCU)Q1

tS(GCU)Q1, Transcript of Mitochondrial serine tRNA (tRNA-Ser), yeastyeast

Gene tS(GCU)Q1, Length 86 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CTL1Q03220 320 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 IES4Q08561 116 aa0.07□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SAL1D6W196 494 aa0.06□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SPT15P13393 240 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PMR1P13586 950 aa0.06□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NAM9P27929 486 aa0.06□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PRP45P28004 379 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data0.06□□□□□ -2.4not detected
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RMA1P36001 430 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPF2P36160 344 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SWD3P38123 315 aa0.06□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PCM1P38628 557 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SEC31P38968 1273 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DSS1P39112 969 aa0.06□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FET5P43561 622 aa0.06□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RTT101P47050 842 aa0.06□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SHY1P53266 389 aa0.06□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YCL021W-AQ96VH3 125 aa0.06□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GPA1P08539 472 aa0.05□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPR2P40571 144 aa0.05□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 IKS1P47042 667 aa0.05□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SQS1P53866 767 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PRM7Q12459 698 aa0.05□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PCL1P24867 279 aa0.04□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ERG1P32476 496 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RRP3P38712 501 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 COS12P53053 380 aa0.04□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DIA1P54005 336 aa0.04□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TSA2Q04120 196 aa0.04□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YMR027WQ04371 470 aa0.04□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ARP10Q04549 284 aa0.04□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TMA64Q04600 565 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RBD2Q12270 262 aa0.04□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YER145C-AA0A023PYF4 145 aa0.03□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CLN3P13365 580 aa0.03□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PCL2P25693 308 aa0.03□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RFS1P38234 210 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NDT80P38830 627 aa0.03□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ARO9P38840 513 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YJL049WP47048 450 aa0.03□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MAK10Q02197 733 aa0.03□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPM2Q02773 1202 aa0.03□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YEH2Q07950 538 aa0.03□□□□□ -2.4
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MTF1P14908 341 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GID7P25569 745 aa0.02□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MF(ALPHA)2P32435 120 aa0.02□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SIP1P32578 815 aa0.02□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CHK1P38147 527 aa0.02□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YPS6P40583 537 aa0.02□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GUF1P46943 645 aa0.02□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MOT3P54785 490 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MRP2P10663 115 aaPredicted RBP0.01□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SFL1P20134 766 aa0.01□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YBL059WP34224 193 aa0.01□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YRB30P53107 440 aaPredicted RBP0.01□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CIA1Q05583 330 aa0.01□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YLR049CQ12110 428 aa0.01□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YER078W-AQ3E7A2 54 aa0.01□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PHO8P11491 566 aa0□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RVS161P25343 265 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NDC1P32500 655 aa0□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ERG7P38604 731 aa0□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ERC1P38767 581 aa0□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PEA2P40091 420 aa0□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPT2P40327 437 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SGF73P53165 657 aa0□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MDR1P53258 950 aa0□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ARK1P53974 638 aa0□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HNT3Q08702 217 aa0□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 AEP2P22136 580 aa-0.01□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SPC110P32380 944 aa-0.01□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CHS6P40955 746 aa-0.01□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ASI1P54074 624 aa-0.01□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TRE2Q08693 809 aa-0.01□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TMS1Q12116 473 aa-0.01□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 AYT1Q12226 474 aa-0.01□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MEF1P25039 761 aa-0.02□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 LAC1P28496 418 aa-0.02□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SEC65P29478 273 aa-0.02□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TDA3P38758 523 aa-0.02□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RGI2P40188 164 aa-0.02□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SNG1P46950 547 aa-0.02□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 IDS2P46958 469 aa-0.02□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PEF1P53238 335 aa-0.02□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YLR455WQ06188 304 aa-0.02□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 EDE1P34216 1381 aa-0.03□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ADH2P00331 348 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DGR2P32330 852 aa-0.03□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HUL5P53119 910 aa-0.03□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TDA7P53882 636 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GUD1Q07729 489 aa-0.03□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YOL098CQ12496 1037 aa-0.03□□□□□ -2.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SUI3P09064 285 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PTR2P32901 601 aa-0.04□□□□□ -2.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MTC4P38335 694 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
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