RNA–Protein interactions for RNA: YPR175W

DPB2, Transcript of Second largest subunit of DNA polymerase II (DNA polymerase epsilon), yeast

Gene DPB2, Length 2,070 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DPB2	YPR175W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	SMF1	P38925	575 aa		6.27	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	YDR286C	Q05530	114 aa		6.27	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	USV1	Q12132	391 aa		6.27	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	STE4	P18851	423 aa		6.26	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	SAS3	P34218	831 aa		6.26	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	MAL33	P38157	468 aa		6.26	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	DIP5	P53388	608 aa		6.26	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	SKG3	Q06315	1026 aa		6.26	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	NUS1	Q12063	375 aa		6.26	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	YPT6	Q99260	215 aa		6.26	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	PEP3	P27801	918 aa		6.26	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	FMP52	P40008	231 aa		6.26	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	YJL068C	P40363	299 aa		6.26	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	SKP2	P42843	763 aa		6.26	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	YEH1	Q07804	573 aa		6.26	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	NTH1	P32356	751 aa		6.25	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	MNN2	P38069	597 aa		6.25	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	NMA2	P53204	395 aa		6.25	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	BUD17	P53727	317 aa		6.25	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	YDL086W	Q07505	273 aa		6.25	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	BUD7	Q08754	746 aa		6.25	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	MET3	P08536	511 aa		6.24	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	PCT1	P13259	424 aa		6.24	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	GPI10	P30777	616 aa		6.24	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	GCS1	P35197	352 aa		6.24	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	NPA3	P47122	385 aa		6.24	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	YGR151C	P53287	111 aa		6.24	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	SFI1	Q12369	946 aa		6.24	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	LIP5	P32875	414 aa		6.24	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	YIP4	P53093	235 aa		6.24	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	YDL242W	Q07746	117 aa		6.24	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	HIF1	Q12373	385 aa		6.24	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	CNE1	P27825	502 aa		6.23	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	DBF4	P32325	704 aa		6.23	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	ATG23	Q06671	453 aa		6.23	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	RKI1	Q12189	258 aa		6.23	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		6.23	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	REV7	P38927	245 aa		6.22	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	INA17	Q02888	182 aa		6.22	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	RMT2	Q03305	412 aa		6.22	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	PMS1	P14242	873 aa		6.22	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	TOD6	P34219	525 aa		6.22	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	THI80	P35202	319 aa		6.22	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	JEM1	P40358	645 aa		6.22	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	PHO23	P50947	330 aa		6.22	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	COX1	P00401	534 aa		6.21	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	SWC3	P31376	625 aa		6.21	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	STB6	P36085	766 aa		6.21	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	CCL1	P37366	393 aa		6.21	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	CST26	P38226	397 aa		6.21	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	RXT2	P38255	430 aa		6.21	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	ERC1	P38767	581 aa		6.21	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	CAJ1	P39101	391 aa		6.21	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	PES4	P39684	611 aa		6.21	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	MSY1	P48527	492 aa		6.21	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	YML037C	Q03703	340 aa		6.21	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	PGC1	Q08959	321 aa		6.21	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		6.21	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		6.21	□□□□□ -1.41
DPB2	YPR175W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
DPB2	YPR175W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
DPB2	YPR175W	PDE1	P22434	369 aa		6.21	□□□□□ -1.42
DPB2	YPR175W	STE11	P23561	717 aa		6.21	□□□□□ -1.42
DPB2	YPR175W	ERG4	P25340	473 aa		6.21	□□□□□ -1.42
DPB2	YPR175W	ANP1	P32629	500 aa		6.21	□□□□□ -1.42
DPB2	YPR175W	DOT5	P40553	215 aa		6.21	□□□□□ -1.42
DPB2	YPR175W	MFM1	Q02783	413 aa		6.21	□□□□□ -1.42
DPB2	YPR175W	UBP16	Q02863	499 aa		6.21	□□□□□ -1.42
DPB2	YPR175W	YLR040C	Q07988	224 aa		6.21	□□□□□ -1.42
DPB2	YPR175W	STE12	P13574	688 aa		6.2	□□□□□ -1.42
DPB2	YPR175W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
DPB2	YPR175W	PRE8	P23639	250 aa		6.2	□□□□□ -1.42
DPB2	YPR175W	SNT1	P25357	1226 aa		6.2	□□□□□ -1.42
DPB2	YPR175W	CTK2	P46962	323 aa		6.2	□□□□□ -1.42
DPB2	YPR175W	ECL1	P48235	211 aa		6.2	□□□□□ -1.42
DPB2	YPR175W	UFO1	Q04511	668 aa		6.2	□□□□□ -1.42
DPB2	YPR175W	CRN1	Q06440	651 aa		6.2	□□□□□ -1.42
DPB2	YPR175W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	6.19	□□□□□ -1.42
DPB2	YPR175W	RIM8	P53179	542 aa		6.19	□□□□□ -1.42

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 34.7 ms