RNA–Protein interactions for RNA: YOR179C

SYC1, Transcript of Subunit of the APT subcomplex of cleavage and polyadenylation factor, yeast

Gene SYC1, Length 567 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYC1	YOR179C	RTC1	Q08281	1341 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	SAN1	P22470	610 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	LYS14	P40971	790 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	CIR1	P42940	261 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	BSC5	P53755	489 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	FCP1	Q03254	732 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	RCO1	Q04779	684 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	SKM1	Q12469	655 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	CDC16	P09798	840 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	RPN12	P32496	274 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	PAH1	P32567	862 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	TFC3	P34111	1160 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	FMP10	P40098	244 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	MSY1	P48527	492 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	YAT1	P80235	687 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	ARO10	Q06408	635 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	CRN1	Q06440	651 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	SWA2	Q06677	668 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	PSK2	Q08217	1101 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	YOR389W	Q08912	624 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	BAG7	Q12128	409 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	RRI2	Q12348	645 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	YOR019W	Q99248	730 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	BNR1	P40450	1375 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	BI2	P03873	423 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	AAC3	P18238	307 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	SRB5	P32585	307 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	ALY1	P36117	915 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	UBP7	P40453	1071 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	SAE2	P46946	345 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	TAX4	P47030	604 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	ENT4	Q07872	247 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	YOR111W	Q99210	232 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SYC1	YOR179C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	YSP3	P25036	478 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	PTC6	P25646	442 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	SIP4	P46954	829 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	YML122C	Q03207	126 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	RAD34	Q06665	692 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	GSY2	P27472	705 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	CDC15	P27636	974 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	FLO10	P36170	1169 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	IME4	P41833	600 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	YNR061C	P53747	219 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	YNL058C	P53947	316 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	RAD30	Q04049	632 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	PCT1	P13259	424 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	PRE8	P23639	250 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	IMP2'	P32351	346 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	GSH1	P32477	678 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	HOT13	P36078	116 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	APD1	P38281	316 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	SLZ1	P40167	298 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	SWP82	P43554	623 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	YSA1	Q01976	231 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	YPL071C	Q02864	156 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	MUB1	Q03162	620 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	SEM1	O94742	89 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	PEX2	P32800	271 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	FTH1	P38310	465 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	ASG1	P40467	964 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	AAD10	P47182	288 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	INN1	P53901	409 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	THI3	Q07471	609 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	OSW1	Q08692	278 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	HUA2	Q12134	243 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	MED1	Q12321	566 aa		4.12	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	ERG11	P10614	530 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	LHS1	P36016	881 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SYC1	YOR179C	ESL2	P36168	1195 aa		4.11	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.8 ms