RNA–Protein interactions for RNA: YOR033C

EXO1, Transcript of 5'-3' exonuclease and flap-endonuclease, yeast

Gene EXO1, Length 2,109 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EXO1	YOR033C	COS1	P53822	381 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	YMR279C	Q03263	540 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	RUB1	Q03919	77 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	VTA1	Q06263	330 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	THI3	Q07471	609 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	PSF3	Q12146	194 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	ATG31	Q12421	196 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	VCX1	Q99385	411 aa		5.19	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	CHS2	P14180	963 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	PUT4	P15380	627 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	MET8	P15807	274 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	PRD1	P25375	712 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	HEM3	P28789	327 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	MEI5	P32489	222 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	ELF1	P36053	145 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	NUP133	P36161	1157 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	MRPL7	P36519	292 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	MRPL37	P36532	105 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	YHL050C	P38721	697 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	OSH7	P38755	437 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	PAN5	P38787	379 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	YHR219W	P38900	624 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	PCL7	P40186	285 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	SLM1	P40485	686 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	EFM4	P40516	257 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	NEO1	P40527	1151 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	YJL016W	P47072	561 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	THI11	P47183	340 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	DIE2	P50076	525 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	YDR239C	Q03780	787 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	YDR131C	Q03899	556 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	SAS4	Q04003	481 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	RGA2	Q06407	1009 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	HAT1	Q12341	374 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	DCN1	Q12395	269 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	ULS1	Q08562	1619 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	PDR11	P40550	1411 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	RPN13	O13563	156 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	PHO5	P00635	467 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	CTT1	P06115	562 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	FBP1	P09201	348 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	MTF2	P10849	440 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	HSF1	P10961	833 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	PRI2	P20457	528 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	IRE1	P32361	1115 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	MRP4	P32902	394 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	YHR202W	P38887	602 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	MSE1	P48525	536 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	MND1	P53102	219 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	APP1	P53933	587 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	SPH1	Q06160	661 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	GRS2	Q06817	618 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	YDL129W	Q07555	291 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	RTT109	Q07794	436 aa		5.18	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	ABF1	P14164	731 aa		5.17	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.17	□□□□□ -1.58	not detected
EXO1	YOR033C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	YJU3	P28321	313 aa		5.17	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	PEX3	P28795	441 aa		5.17	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	FBP26	P32604	452 aa		5.17	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	PPG1	P32838	368 aa		5.17	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	SRP101	P32916	621 aa		5.17	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	ETR1	P38071	380 aa		5.17	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	YHL017W	P38745	532 aa		5.17	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	ERP5	P38819	212 aa		5.17	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	PRM9	P39551	298 aa		5.17	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	ZIM17	P42844	174 aa		5.17	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	IDS2	P46958	469 aa		5.17	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	RCF2	P53721	224 aa		5.17	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	SDH1	Q00711	640 aa		5.17	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	ARO10	Q06408	635 aa		5.17	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	GSH2	Q08220	491 aa		5.17	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	FEX1	Q08913	375 aa		5.17	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	YPT6	Q99260	215 aa		5.17	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	HMG2	P12684	1045 aa		5.17	□□□□□ -1.58
EXO1	YOR033C	CDC23	P16522	626 aa		5.17	□□□□□ -1.58

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