RNA–Protein interactions for RNA: YHR134W

WSS1, Transcript of Metalloprotease involved in DNA repair, removes DNA-protein crosslinks at stalled replication forks during replication of damaged DNA, yeast

Gene WSS1, Length 810 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
WSS1	YHR134W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		5	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		5	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		5	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	PTH2	P34222	208 aa		5	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	ORC5	P50874	479 aa		5	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	DNA2	P38859	1522 aa		4.99	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	SPO16	P17122	198 aa		4.99	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	XRS2	P33301	854 aa		4.99	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	MRPL36	P36531	177 aa		4.99	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	ARN1	P38731	627 aa		4.99	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	IES5	P40060	125 aa		4.99	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	PCI8	P40512	444 aa		4.99	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	YJL107C	P42947	387 aa		4.99	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	UBX6	P47049	396 aa		4.99	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	TFC6	Q06339	672 aa		4.99	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	THI3	Q07471	609 aa		4.99	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	PSR2	Q07949	397 aa		4.99	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.99	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	RGT2	Q12300	763 aa		4.99	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	BLI1	P35727	113 aa		4.98	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	EXO84	P38261	753 aa		4.98	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	JHD1	P40034	492 aa		4.98	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	SEC5	P89102	971 aa		4.98	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	MEH1	Q02205	184 aa		4.98	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	BLS1	Q06071	122 aa		4.98	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	PCT1	P13259	424 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	ERP2	P39704	215 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	YIL024C	P40543	189 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	SWT1	Q12104	458 aa		4.97	□□□□□ -1.61
WSS1	YHR134W	YPR089W	O13585	888 aa		4.96	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	DAL5	P15365	543 aa		4.96	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	YSP3	P25036	478 aa		4.96	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	NUP120	P35729	1037 aa		4.96	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	ASK1	P35734	292 aa		4.96	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	ERR3	P42222	437 aa		4.96	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	GAT1	P43574	510 aa		4.96	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	ZAP1	P47043	880 aa		4.96	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	YDL121C	Q07541	149 aa		4.96	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	GEP3	Q08622	556 aa		4.96	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	DBF20	P32328	564 aa		4.95	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	OCT1	P35999	772 aa		4.95	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	ASG1	P40467	964 aa		4.95	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	YPR003C	P53394	754 aa		4.95	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.95	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	CNA1	P23287	553 aa		4.94	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	MSS51	P32335	436 aa		4.94	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	PSF2	P40359	213 aa		4.94	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	SAP185	P40856	1058 aa		4.94	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	CTF18	P49956	741 aa		4.94	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	ASE1	P50275	885 aa		4.94	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	PIG1	Q06216	648 aa		4.94	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	YAP7	Q08182	245 aa		4.94	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	SSN2	P38931	1420 aa		4.94	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	SPT7	P35177	1332 aa		4.94	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	GAL4	P04386	881 aa		4.93	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	NUC1	P08466	329 aa		4.93	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	PDR8	Q06149	701 aa		4.93	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	PSK2	Q08217	1101 aa		4.93	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	ATX2	Q12067	313 aa		4.93	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	DPB3	P27344	201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	MGM1	P32266	881 aa		4.92	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	VPS41	P38959	992 aa		4.92	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	ATG16	Q03818	150 aa		4.92	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	PFA4	Q12006	378 aa		4.92	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	RRI1	Q12468	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.91	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.91	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.91	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	OPI1	P21957	404 aa		4.91	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
WSS1	YHR134W	TY2A-C	P25383	438 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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