RNA–Protein interactions for RNA: YDR457W

TOM1, Transcript of E3 ubiquitin ligase of the hect-domain class, yeast

Gene TOM1, Length 9,807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOM1	YDR457W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	PCK1	P10963	549 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	NPP1	P25353	742 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	PHA2	P32452	334 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	TRM2	P33753	639 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	CTF13	P35203	478 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	YHR045W	P38775	560 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	BIT61	P47041	543 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	PEX29	Q03370	554 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	YPL257W	Q08974	193 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	YPL277C	Q08989	487 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	LAP2	Q10740	671 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	DCS2	Q12123	353 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	YOR111W	Q99210	232 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	DBF2	P22204	572 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	IFA38	P38286	347 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	EFM1	P38732	585 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	PUS2	P53167	370 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	YGR127W	P53275	312 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	MDM32	Q12171	622 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	APC2	Q12440	853 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	VCX1	Q99385	411 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	TRP3	P00937	484 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	RAD6	P06104	172 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	DSF2	P38213	736 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	MSG5	P38590	489 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	SLX8	P40072	274 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	BNA6	P43619	295 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	ASG7	P46993	209 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	CWC24	P53769	259 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	MUB1	Q03162	620 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	UIP4	Q08926	304 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOM1	YDR457W	ARG3	P05150	338 aa		2.78	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MIH1	P23748	554 aa		2.78	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	AFG1	P32317	509 aa		2.78	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	KTR2	P33550	425 aa		2.78	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	CDS1	P38221	457 aa		2.78	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SIW14	P53965	281 aa		2.78	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RPM2	Q02773	1202 aa		2.78	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YML020W	Q03722	664 aa		2.78	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	HMI1	Q12039	706 aa		2.78	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	GCN4	P03069	281 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SPO12	P17123	173 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PCH2	P38126	564 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	LAS21	P40367	830 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YJL055W	P47044	245 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	DAS2	Q12084	232 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RTR2	Q12378	196 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	NUP2	P32499	720 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YDR514C	Q04408	483 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	VID22	Q05934	901 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RTT10	Q08924	1013 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PSY3	Q12318	242 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	AFT1	P22149	690 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	TOD6	P34219	525 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	APD1	P38281	316 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MDM31	P38880	579 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SKP2	P42843	763 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YFH7	P43591	353 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RMD8	P43620	662 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	YJR098C	P47139	656 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	HUA2	Q12134	243 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	NYV1	Q12255	253 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	HMG1	P12683	1054 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	CKA2	P19454	339 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RAD57	P25301	460 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	SYN8	P31377	255 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	NTH2	P35172	780 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	RIM11	P38615	370 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOM1	YDR457W	PEX18	P38855	283 aa		2.77	□□□□□ -1.97

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