RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557987.5

BNIP2-209, Transcript of BCL2 interacting protein 2, human

TSL 3

Gene BNIP2, Length 603 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BNIP2-209	ENST00000557987	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	WDR18	Q9BV38	432 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	STIM2	Q9P246	746 aa		4.61	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	TMPRSS2	O15393	492 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	ICMT	O60725	284 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	ECEL1	O95672	775 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	IGHA2	P01877	340 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	ABTB2	Q8N961	1025 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	NBPF4	Q96M43	638 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	SLAIN2	Q9P270	581 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	PNMA2	Q9UL42	364 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		4.6	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987		H3BRB1	525 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	ANP32C	O43423	234 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	SUV39H1	O43463	412 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	EDN3	P14138	238 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	ITIH2	P19823	946 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	PCDH1	Q08174	1060 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	KCNN1	Q92952	543 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		4.59	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
BNIP2-209	ENST00000557987	CCER2	I3L3R5	266 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	4.58	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	PDGFRB	P09619	1106 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	ZNF76	P36508	570 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	UBE4A	Q14139	1066 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	MKL1	Q969V6	931 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	CORO1B	Q9BR76	489 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	MRS2	Q9HD23	443 aa		4.58	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	METTL12	A8MUP2	240 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	EREG	O14944	169 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	PLIN1	O60240	522 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	BDNF	P23560	247 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	MAN1A1	P33908	653 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	GYS2	P54840	703 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	POU5F1B	Q06416	359 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	VPS72	Q15906	364 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	TMC4	Q7Z404	712 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	VPS37D	Q86XT2	251 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	JDP2	Q8WYK2	163 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		4.57	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	CCDC189	A1A4V9	331 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	KIF3B	O15066	747 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	SORBS3	O60504	671 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	TRIM13	O60858	407 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	CELA3B	P08861	270 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	CLCN7	P51798	805 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	ODR4	Q5SWX8	454 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	ZNF280D	Q6N043	979 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
BNIP2-209	ENST00000557987	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		4.56	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.2 ms