RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MMP1P03956 469 aa25.33■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POLD1P28340 1107 aa25.33■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NOVP48745 357 aa25.33■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PNMA1Q8ND90 353 aa25.33■■□□□ 1.65
GADD45GIP1-201ENST00000316939 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP25.32■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC82Q8N4S0 544 aa25.32■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP25.32■■□□□ 1.645e-6■■■■■ 32.2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SWAP70Q9UH65 585 aa25.32■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 YEATS4O95619 227 aa25.31■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NASPP49321 788 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PKN1Q16512 942 aa25.31■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IDI2Q9BXS1 227 aa25.31■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PIM2Q9P1W9 311 aa25.31■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa25.31■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TAOK2Q9UL54 1235 aa25.31■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa25.3■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COL4A5P29400 1685 aa25.3■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GRM4Q14833 912 aa25.3■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LINC00301Q8NCQ3 95 aa25.3■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EHD4Q9H223 541 aa25.3■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SERPINB13Q9UIV8 391 aa25.3■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SIPA1L1O43166 1804 aa25.3■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 XBP1P17861 261 aa25.29■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM47Q9BQJ4 181 aa25.29■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HLA-DOAP06340 250 aa25.28■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LIG1P18858 919 aa25.28■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NFIAQ12857 509 aa25.28■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNG4Q8TDN1 519 aa25.28■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GNAQP50148 359 aa25.28■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LARGE2Q8N3Y3 721 aa25.28■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STX8Q9UNK0 236 aa25.28■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 V9GY48 417 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TPRNQ4KMQ1 711 aa25.27■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANO1Q5XXA6 986 aa25.27■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NOSTRINQ8IVI9 506 aa25.27■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLIC4Q9Y696 253 aa25.27■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.64
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VIL1P09327 827 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BICD2Q8TD16 824 aa25.26■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNJ14Q9UNX9 436 aa25.26■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa25.26■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TOP1P11387 765 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CEP95Q96GE4 821 aa25.26■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GMLQ99445 158 aa25.26■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAD2L2Q9UI95 211 aa25.26■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa25.25■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STK38Q15208 465 aa25.25■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PHF20Q9BVI0 1012 aa25.25■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM198AQ9UFP1 575 aa25.25■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A1W2PQ27 194 aa25.24■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A1W2PQ64 194 aa25.24■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A1W2PQD8 194 aa25.24■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BTBD18B2RXH4 712 aa25.24■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SHMT1P34896 483 aa25.24■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ME1P48163 572 aa25.24■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADALQ6DHV7 355 aa25.24■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SHISA4Q96DD7 197 aa25.24■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SGIP1Q9BQI5 828 aa25.24■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LZTS2Q9BRK4 669 aa25.24■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DACT1Q9NYF0 836 aa25.24■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPTLC2O15270 562 aa25.23■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC39A14Q15043 492 aa25.23■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CFAP100Q494V2 611 aa25.23■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNRF3Q9ULT6 936 aa25.23■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCDHA7Q9UN72 937 aa25.23■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCG2P13521 617 aa25.23■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NUP62CLQ9H1M0 184 aa25.23■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TSPY26PQ9H489 355 aa25.23■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MTMR4Q9NYA4 1195 aa25.23■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VPS54Q9P1Q0 977 aa25.23■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATRNL1Q5VV63 1379 aa25.22■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PSMD14O00487 310 aa25.22■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZFPM1Q8IX07 1006 aa25.22■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NIM1KQ8IY84 436 aa25.22■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.22■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ENTPD3O75355 529 aa25.21■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NR1I2O75469 434 aa25.21■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AKR1B1P15121 316 aa25.21■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RILPL1Q5EBL4 403 aa25.21■■□□□ 1.63
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms