RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hip1rQ9JKY5 1068 aa7.49□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Itga2bQ9QUM0 1033 aa7.49□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfand4D3Z3C6 739 aa7.49□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cd3dP04235 173 aa7.49□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RargP18911 458 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vsnl1P62761 191 aa7.49□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fchsd1Q6PFY1 688 aa7.49□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Otop3Q80UF9 577 aa7.49□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tbc1d5Q80XQ2 815 aa7.49□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpt2Q8BGT5 522 aa7.49□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Apol10aQ8CCA5 318 aa7.49□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Washc1Q8VDD8 475 aa7.49□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Txndc5Q91W90 417 aa7.49□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Stag1Q9D3E6 1258 aa7.49□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Scgb2b18A0A087WPA9 112 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm43738A0A0G2JEA5 862 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Frmd7A2AD83 703 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rsph10bE9PYQ0 876 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kiaa1468Q148V7 1216 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ica1lQ3TY65 431 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nek5Q7TSC3 627 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ctdp1Q7TSG2 960 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gga3Q8BMI3 718 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Phldb2Q8K1N2 1249 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tube1Q9D6T1 475 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Bcl9lQ67FY2 1494 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lrp5Q91VN0 1614 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Igsf9bE9PZ19 1328 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MetP16056 1379 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ssc5dQ8BV57 1371 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 4932429P05RikA2ADI4 785 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Abl1P00520 1123 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nkx2-5P42582 318 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Plbd2Q3TCN2 594 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 VeztQ3ZK22 780 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cep112Q5PR68 954 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MmeQ61391 750 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adck2Q6NSR3 617 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dusp9Q7TNL7 452 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ube3cQ80U95 1083 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lrrc1Q80VQ1 524 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rbm28Q8CGC6 750 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Phc3Q8CHP6 981 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ubac1Q8VDI7 409 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sh2b1Q91ZM2 756 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Apobec3Q99J72 440 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ndufb9Q9CQJ8 179 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cfap45Q9D9U9 551 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Znfx1Q8R151 1909 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CluhQ5SW19 1315 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Col20a1Q923P0 1320 aa7.48□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trim34bJ3QNR8 485 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Usp5P56399 858 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q3TYL0 343 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr121Q5CZY0 321 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc38a10Q5I012 1090 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fhod1Q6P9Q4 1197 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nme8Q715T0 586 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ttc12Q8BW49 704 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ufl1Q8CCJ3 793 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc73Q8CDM4 1066 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ApobrQ8VBT6 942 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CrebzfQ91ZR3 358 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Card14Q99KF0 999 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NapgQ9CWZ7 312 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 FliiQ9JJ28 1271 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Egfl6Q9JJZ5 550 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pard3Q99NH2 1333 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm5580A0A0N4SVP8 411 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 A0A1Y7VML8 143 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dennd3A2RT67 1274 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rexo5D3YW29 759 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ugt1a8D3Z748 530 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ugt1a10E9PXN7 530 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm4340L7N2C4 268 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp3a25O09158 503 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pth1rP41593 591 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 RragbQ6NTA4 374 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ano2Q8CFW1 1002 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nod2Q8K3Z0 1020 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mis18aQ9CZJ6 204 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Clstn1Q9EPL2 979 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ercc4Q9QZD4 917 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Foxo4Q9WVH3 505 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Foxo3Q9WVH4 672 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gjb4Q02738 266 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adam6bQ6IMH7 756 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Recql4Q75NR7 1216 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tas2r124Q7M718 309 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Abtb2Q7TQI7 1024 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dnph1Q80VJ3 173 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Krt222Q8CCX5 294 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sash3Q8K352 380 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pcdha12Q91Y18 950 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam217aQ9D9W6 419 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lmbr1Q9JIT0 490 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tob2Q9JM55 345 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kank3Q9Z1P7 791 aa7.47□□□□□ -1.21
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NesQ6P5H2 1864 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 58.5 ms