Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

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Length 524 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Lrrc1Q80VQ1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Lrrc1Q80VQ1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Lrrc1Q80VQ1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Lrrc1Q80VQ1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Lrrc1Q80VQ1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Lrrc1Q80VQ1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Lrrc1Q80VQ1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Lrrc1Q80VQ1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Lrrc1Q80VQ1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Lrrc1Q80VQ1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Lrrc1Q80VQ1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Lrrc1Q80VQ1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lrrc1Q80VQ1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Lrrc1Q80VQ1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Lrrc1Q80VQ1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lrrc1Q80VQ1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lrrc1Q80VQ1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Lrrc1Q80VQ1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.89■■■□□ 2.69
Lrrc1Q80VQ1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Lrrc1Q80VQ1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Lrrc1Q80VQ1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Lrrc1Q80VQ1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Lrrc1Q80VQ1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Lrrc1Q80VQ1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Lrrc1Q80VQ1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Lrrc1Q80VQ1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Lrrc1Q80VQ1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Lrrc1Q80VQ1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Lrrc1Q80VQ1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Lrrc1Q80VQ1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Lrrc1Q80VQ1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Lrrc1Q80VQ1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Lrrc1Q80VQ1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Lrrc1Q80VQ1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Lrrc1Q80VQ1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Lrrc1Q80VQ1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Lrrc1Q80VQ1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Lrrc1Q80VQ1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Lrrc1Q80VQ1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Lrrc1Q80VQ1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Lrrc1Q80VQ1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Lrrc1Q80VQ1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Lrrc1Q80VQ1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Lrrc1Q80VQ1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Lrrc1Q80VQ1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Lrrc1Q80VQ1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Lrrc1Q80VQ1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Lrrc1Q80VQ1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lrrc1Q80VQ1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Lrrc1Q80VQ1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Lrrc1Q80VQ1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Lrrc1Q80VQ1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Lrrc1Q80VQ1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lrrc1Q80VQ1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Lrrc1Q80VQ1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Lrrc1Q80VQ1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lrrc1Q80VQ1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lrrc1Q80VQ1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lrrc1Q80VQ1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lrrc1Q80VQ1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lrrc1Q80VQ1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lrrc1Q80VQ1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lrrc1Q80VQ1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lrrc1Q80VQ1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lrrc1Q80VQ1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lrrc1Q80VQ1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lrrc1Q80VQ1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Lrrc1Q80VQ1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Lrrc1Q80VQ1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lrrc1Q80VQ1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Lrrc1Q80VQ1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Lrrc1Q80VQ1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Lrrc1Q80VQ1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Lrrc1Q80VQ1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lrrc1Q80VQ1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lrrc1Q80VQ1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lrrc1Q80VQ1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lrrc1Q80VQ1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Lrrc1Q80VQ1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lrrc1Q80VQ1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lrrc1Q80VQ1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lrrc1Q80VQ1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lrrc1Q80VQ1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lrrc1Q80VQ1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lrrc1Q80VQ1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lrrc1Q80VQ1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrrc1Q80VQ1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrrc1Q80VQ1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrrc1Q80VQ1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lrrc1Q80VQ1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Lrrc1Q80VQ1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lrrc1Q80VQ1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lrrc1Q80VQ1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lrrc1Q80VQ1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lrrc1Q80VQ1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lrrc1Q80VQ1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lrrc1Q80VQ1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lrrc1Q80VQ1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
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