Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Q4

Fhod1, FH1/FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod1Q6P9Q4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.74■■■■■ 4.27
Fhod1Q6P9Q4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Fhod1Q6P9Q4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Fhod1Q6P9Q4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Fhod1Q6P9Q4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Fhod1Q6P9Q4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Fhod1Q6P9Q4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Fhod1Q6P9Q4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Fhod1Q6P9Q4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Fhod1Q6P9Q4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Fhod1Q6P9Q4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Fhod1Q6P9Q4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Fhod1Q6P9Q4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Fhod1Q6P9Q4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Fhod1Q6P9Q4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Fhod1Q6P9Q4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Fhod1Q6P9Q4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Fhod1Q6P9Q4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Fhod1Q6P9Q4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Fhod1Q6P9Q4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Fhod1Q6P9Q4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Fhod1Q6P9Q4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Fhod1Q6P9Q4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Fhod1Q6P9Q4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Fhod1Q6P9Q4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Fhod1Q6P9Q4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Fhod1Q6P9Q4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Fhod1Q6P9Q4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Fhod1Q6P9Q4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Fhod1Q6P9Q4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Fhod1Q6P9Q4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Fhod1Q6P9Q4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Fhod1Q6P9Q4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Fhod1Q6P9Q4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Fhod1Q6P9Q4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Fhod1Q6P9Q4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Fhod1Q6P9Q4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Fhod1Q6P9Q4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Fhod1Q6P9Q4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Fhod1Q6P9Q4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Fhod1Q6P9Q4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Fhod1Q6P9Q4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Fhod1Q6P9Q4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Fhod1Q6P9Q4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Fhod1Q6P9Q4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fhod1Q6P9Q4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Fhod1Q6P9Q4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Fhod1Q6P9Q4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Fhod1Q6P9Q4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Fhod1Q6P9Q4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Fhod1Q6P9Q4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Fhod1Q6P9Q4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Fhod1Q6P9Q4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Fhod1Q6P9Q4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Fhod1Q6P9Q4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Fhod1Q6P9Q4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Fhod1Q6P9Q4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Fhod1Q6P9Q4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Fhod1Q6P9Q4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Fhod1Q6P9Q4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Fhod1Q6P9Q4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Fhod1Q6P9Q4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Fhod1Q6P9Q4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Fhod1Q6P9Q4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Fhod1Q6P9Q4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Fhod1Q6P9Q4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Fhod1Q6P9Q4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Fhod1Q6P9Q4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Fhod1Q6P9Q4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Fhod1Q6P9Q4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Fhod1Q6P9Q4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Fhod1Q6P9Q4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Fhod1Q6P9Q4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Fhod1Q6P9Q4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Fhod1Q6P9Q4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Fhod1Q6P9Q4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Fhod1Q6P9Q4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Fhod1Q6P9Q4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Fhod1Q6P9Q4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Fhod1Q6P9Q4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Fhod1Q6P9Q4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Fhod1Q6P9Q4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Fhod1Q6P9Q4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Fhod1Q6P9Q4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Fhod1Q6P9Q4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Fhod1Q6P9Q4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Fhod1Q6P9Q4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Fhod1Q6P9Q4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Fhod1Q6P9Q4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Fhod1Q6P9Q4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Fhod1Q6P9Q4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Fhod1Q6P9Q4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
Fhod1Q6P9Q4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Fhod1Q6P9Q4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Fhod1Q6P9Q4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fhod1Q6P9Q4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fhod1Q6P9Q4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Fhod1Q6P9Q4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Fhod1Q6P9Q4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Fhod1Q6P9Q4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms