Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
Rsph10bE9PYQ0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Rsph10bE9PYQ0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Rsph10bE9PYQ0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Rsph10bE9PYQ0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Rsph10bE9PYQ0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Rsph10bE9PYQ0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Rsph10bE9PYQ0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Rsph10bE9PYQ0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Rsph10bE9PYQ0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Rsph10bE9PYQ0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Rsph10bE9PYQ0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Rsph10bE9PYQ0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Rsph10bE9PYQ0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Rsph10bE9PYQ0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Rsph10bE9PYQ0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Rsph10bE9PYQ0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rsph10bE9PYQ0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rsph10bE9PYQ0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Rsph10bE9PYQ0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Rsph10bE9PYQ0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Rsph10bE9PYQ0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rsph10bE9PYQ0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Rsph10bE9PYQ0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Rsph10bE9PYQ0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Rsph10bE9PYQ0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rsph10bE9PYQ0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rsph10bE9PYQ0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Rsph10bE9PYQ0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Rsph10bE9PYQ0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rsph10bE9PYQ0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Rsph10bE9PYQ0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rsph10bE9PYQ0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rsph10bE9PYQ0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Rsph10bE9PYQ0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rsph10bE9PYQ0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rsph10bE9PYQ0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rsph10bE9PYQ0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rsph10bE9PYQ0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rsph10bE9PYQ0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rsph10bE9PYQ0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rsph10bE9PYQ0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rsph10bE9PYQ0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rsph10bE9PYQ0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rsph10bE9PYQ0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rsph10bE9PYQ0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Rsph10bE9PYQ0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rsph10bE9PYQ0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rsph10bE9PYQ0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rsph10bE9PYQ0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rsph10bE9PYQ0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rsph10bE9PYQ0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rsph10bE9PYQ0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rsph10bE9PYQ0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rsph10bE9PYQ0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Rsph10bE9PYQ0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rsph10bE9PYQ0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rsph10bE9PYQ0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rsph10bE9PYQ0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rsph10bE9PYQ0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rsph10bE9PYQ0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Rsph10bE9PYQ0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rsph10bE9PYQ0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rsph10bE9PYQ0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Rsph10bE9PYQ0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rsph10bE9PYQ0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rsph10bE9PYQ0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Rsph10bE9PYQ0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Rsph10bE9PYQ0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Rsph10bE9PYQ0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Rsph10bE9PYQ0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Rsph10bE9PYQ0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Rsph10bE9PYQ0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Rsph10bE9PYQ0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rsph10bE9PYQ0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rsph10bE9PYQ0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rsph10bE9PYQ0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Rsph10bE9PYQ0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Rsph10bE9PYQ0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Rsph10bE9PYQ0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Rsph10bE9PYQ0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Rsph10bE9PYQ0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Rsph10bE9PYQ0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Rsph10bE9PYQ0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Rsph10bE9PYQ0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Rsph10bE9PYQ0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Rsph10bE9PYQ0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Rsph10bE9PYQ0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rsph10bE9PYQ0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Rsph10bE9PYQ0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Rsph10bE9PYQ0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rsph10bE9PYQ0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Rsph10bE9PYQ0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Rsph10bE9PYQ0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Rsph10bE9PYQ0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Rsph10bE9PYQ0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Rsph10bE9PYQ0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms