Protein–RNA interactions for Protein: P41593

Pth1r, Parathyroid hormone/parathyroid hormone-related peptide receptor, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pth1rP41593 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Pth1rP41593 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
Pth1rP41593 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Pth1rP41593 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Pth1rP41593 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Pth1rP41593 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Pth1rP41593 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Pth1rP41593 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Pth1rP41593 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Pth1rP41593 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Pth1rP41593 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Pth1rP41593 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Pth1rP41593 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Pth1rP41593 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Pth1rP41593 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Pth1rP41593 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Pth1rP41593 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Pth1rP41593 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Pth1rP41593 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Pth1rP41593 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Pth1rP41593 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Pth1rP41593 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Pth1rP41593 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Pth1rP41593 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Pth1rP41593 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Pth1rP41593 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Pth1rP41593 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Pth1rP41593 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Pth1rP41593 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Pth1rP41593 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Pth1rP41593 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Pth1rP41593 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Pth1rP41593 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Pth1rP41593 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Pth1rP41593 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Pth1rP41593 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Pth1rP41593 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Pth1rP41593 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Pth1rP41593 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Pth1rP41593 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Pth1rP41593 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Pth1rP41593 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Pth1rP41593 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Pth1rP41593 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Pth1rP41593 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Pth1rP41593 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Pth1rP41593 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Pth1rP41593 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Pth1rP41593 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Pth1rP41593 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Pth1rP41593 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Pth1rP41593 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Pth1rP41593 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Pth1rP41593 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Pth1rP41593 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Pth1rP41593 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Pth1rP41593 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Pth1rP41593 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Pth1rP41593 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Pth1rP41593 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Pth1rP41593 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Pth1rP41593 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Pth1rP41593 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Pth1rP41593 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Pth1rP41593 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Pth1rP41593 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Pth1rP41593 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Pth1rP41593 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Pth1rP41593 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pth1rP41593 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Pth1rP41593 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pth1rP41593 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pth1rP41593 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Pth1rP41593 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Pth1rP41593 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pth1rP41593 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pth1rP41593 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Pth1rP41593 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pth1rP41593 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pth1rP41593 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pth1rP41593 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pth1rP41593 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pth1rP41593 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pth1rP41593 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pth1rP41593 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pth1rP41593 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pth1rP41593 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pth1rP41593 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pth1rP41593 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pth1rP41593 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pth1rP41593 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pth1rP41593 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pth1rP41593 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pth1rP41593 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pth1rP41593 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pth1rP41593 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pth1rP41593 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pth1rP41593 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pth1rP41593 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pth1rP41593 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms