RNA–Protein interactions for RNA: YPL166W

ATG29, Transcript of Autophagy-specific protein, yeast

Gene ATG29, Length 642 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG29	YPL166W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	SKP2	P42843	763 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	IMA1	P53051	589 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	UBX4	P54730	416 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	YAT1	P80235	687 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	RSC9	Q03124	581 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	PET122	P10355	254 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	MAK32	P23060	363 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	NPA3	P47122	385 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	RAD34	Q06665	692 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	SUL2	Q12325	893 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	BIK1	P11709	440 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	CLB4	P24871	460 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	ACA1	P39970	489 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	PUG1	P40100	303 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	IRC7	P43623	340 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	URK1	P27515	501 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	YBR138C	P38277	524 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	TPM2	P40414	161 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	UBX6	P47049	396 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	TAM41	P53230	385 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	YGR079W	P53249	370 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATG29	YPL166W	COX1	P00401	534 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	LAC1	P28496	418 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	CIN1	P40987	1014 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	GTB1	Q04924	702 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	MSM1	P22438	575 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	PTC6	P25646	442 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	HES1	P35843	434 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	STB2	P46679	850 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	ZAP1	P47043	880 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	CRC1	Q12289	327 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	GSH1	P32477	678 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	COQ3	P27680	312 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	MRPL36	P36531	177 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	ERV46	P39727	415 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	BUD16	P39988	312 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	PSF2	P40359	213 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	BLS1	Q06071	122 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	NUC1	P08466	329 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	YCL049C	P25577	312 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	NUP120	P35729	1037 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	JHD1	P40034	492 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	UBP7	P40453	1071 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	ERR3	P42222	437 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	ORC5	P50874	479 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	CIA1	Q05583	330 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	ATG23	Q06671	453 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	THI3	Q07471	609 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	MSS51	P32335	436 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	PTH2	P34222	208 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	NPR3	P38742	1146 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	YIL024C	P40543	189 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	DJP1	P40564	432 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	STP3	Q05937	343 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ATG29	YPL166W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATG29	YPL166W	DBF20	P32328	564 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG29	YPL166W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATG29	YPL166W	MNT3	P40549	630 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG29	YPL166W	CFD1	P40558	293 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG29	YPL166W	MEP2	P41948	499 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG29	YPL166W	MSY1	P48527	492 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG29	YPL166W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATG29	YPL166W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG29	YPL166W	SWT1	Q12104	458 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG29	YPL166W	BAG7	Q12128	409 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ATG29	YPL166W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
ATG29	YPL166W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
ATG29	YPL166W	IRC8	P47046	822 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG29	YPL166W	YPR003C	P53394	754 aa		4.7	□□□□□ -1.66
ATG29	YPL166W	PFA4	Q12006	378 aa		4.7	□□□□□ -1.66

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