RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeastyeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4YKL049C LYS21Q12122 440 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C CRC1Q12289 327 aa3.33□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C ILV2P07342 687 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C ILS1P09436 1072 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C PET122P10355 254 aa3.32□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C ECM32P32644 1121 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C YHL041WP38730 149 aa3.32□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C CIN1P40987 1014 aa3.32□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C YGR079WP53249 370 aa3.32□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C YAP7Q08182 245 aa3.32□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C RGT2Q12300 763 aa3.32□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C COX1P00401 534 aa3.31□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C PHO81P17442 1178 aa3.31□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C SEC18P18759 758 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C COQ3P27680 312 aa3.31□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C FUN12P39730 1002 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C YIL024CP40543 189 aa3.31□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C UBX6P47049 396 aa3.31□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C IMA1P53051 589 aa3.31□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C TAM41P53230 385 aa3.31□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C SUL2Q12325 893 aa3.31□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C PTC6P25646 442 aa3.3□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C URK1P27515 501 aa3.3□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C LAC1P28496 418 aa3.3□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C ARP2P32381 391 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C GSH1P32477 678 aa3.3□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C GCD7P32502 381 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C JHD1P40034 492 aa3.3□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C MNT3P40549 630 aa3.3□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C SKP2P42843 763 aa3.3□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C COP1P53622 1201 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C PAP2P53632 584 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C GTB1Q04924 702 aa3.3□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C RVB2Q12464 471 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C BIK1P11709 440 aa3.29□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C YBR138CP38277 524 aa3.29□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C FSH1P38777 243 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C ERV46P39727 415 aa3.29□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C PUG1P40100 303 aa3.29□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C UBP7P40453 1071 aa3.29□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C FAF1P40546 346 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C CFD1P40558 293 aa3.29□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C MTG1Q03151 367 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C GEP3Q08622 556 aa3.29□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C LEA1Q08963 238 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C GET3Q12154 354 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C CLB4P24871 460 aa3.28□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C HES1P35843 434 aa3.28□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C ACA1P39970 489 aa3.28□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C PCI8P40512 444 aa3.28□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C ZAP1P47043 880 aa3.28□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C YJR008WP47085 338 aa3.28□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C ORC5P50874 479 aa3.28□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C YRB30P53107 440 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C UBX4P54730 416 aa3.28□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C TRS130Q03660 1102 aa3.28□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C YDR109CQ04585 715 aa3.28□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C PFA4Q12006 378 aa3.28□□□□□ -1.88
CSE4YKL049C MSS51P32335 436 aa3.27□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C SPC97P38863 823 aa3.27□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C YMR124WP39523 943 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C BUD16P39988 312 aa3.27□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C SCW4P53334 386 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C MPS1P54199 764 aa3.27□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C THI3Q07471 609 aa3.27□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C YPR089WO13585 888 aa3.26□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C GAL4P04386 881 aa3.26□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C PGI1P12709 554 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C APA1P16550 321 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C MSM1P22438 575 aa3.26□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C RPT3P33298 428 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C ASK1P35734 292 aa3.26□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C FLO5P38894 1075 aa3.26□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C RPT2P40327 437 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C ERR3P42222 437 aa3.26□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C YJL107CP42947 387 aa3.26□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C YPR003CP53394 754 aa3.26□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C VTC3Q02725 835 aa3.26□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C STP3Q05937 343 aa3.26□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C ATG23Q06671 453 aa3.26□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C HER1Q12276 1246 aa3.26□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C YER190C-BP0CX94 160 aa3.25□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C YEL077W-AP0CX95 160 aa3.25□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C YGR296C-BP0CX96 160 aa3.25□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C YPL283W-BP0CX97 160 aa3.25□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C YPR204C-AP0CX98 160 aa3.25□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C YCL049CP25577 312 aa3.25□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C LRE1P25579 583 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C RFA2P26754 273 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C MRPL36P36531 177 aa3.25□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C ARN1P38731 627 aa3.25□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C DJP1P40564 432 aa3.25□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C CDC1P40986 491 aa3.25□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C MSY1P48527 492 aa3.25□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C ADE16P54113 591 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C MRPL1Q04599 285 aa3.25□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C BAG7Q12128 409 aa3.25□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C SUI3P09064 285 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C YML003WP0CF16 290 aa3.24□□□□□ -1.89
CSE4YKL049C NCP1P16603 691 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
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