RNA–Protein interactions for RNA: YHR029C

YHI9, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YHI9, Length 885 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YHI9	YHR029C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	GYP6	P32806	458 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	LOT5	P34234	306 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	REG2	P38232	338 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	RFC5	P38251	354 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	SIF2	P38262	535 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	SMF1	P38925	575 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	LYS9	P38999	446 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.08	□□□□□ -1.76	not detected
YHI9	YHR029C	OSW5	P40219	148 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	BUD8	P41698	603 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	TOF1	P53840	1238 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	REG1	Q00816	1014 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	YDR132C	Q03900	495 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	SPH1	Q06160	661 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	YPR172W	Q06608	200 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	FMP45	Q07651	309 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	NMD4	Q12129	218 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	SKS1	Q12505	502 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	QCR6	P00127	147 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	PRP28	P23394	588 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	ERV1	P27882	189 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	YHR131C	P38835	850 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	DOT5	P40553	215 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	YNR068C	P53754	272 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	RCO1	Q04779	684 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	GTB1	Q04924	702 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	CDA1	Q06702	301 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	ICL2	Q12031	575 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	ARG1	P22768	420 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	UBP11	P36026	717 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	YHR054C	P38780	354 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.06	□□□□□ -1.76	not detected
YHI9	YHR029C	YEL057C	P39983	233 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	BUD16	P39988	312 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	FMP10	P40098	244 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	RGI2	P40188	164 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	MET18	P40469	1032 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	SSY5	P47002	699 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	TAF4	P50105	388 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	GLO1	P50107	326 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	YGR012W	P53206	393 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	SPO1	P53541	631 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	MSC2	Q03455	724 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	THI22	Q06490	572 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	NUS1	Q12063	375 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	AFI1	Q99222	893 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	GAL10	P04397	699 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	YML002W	P0CF17	737 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	ERG8	P24521	451 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	TY2A-C	P25383	438 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	RAD51	P25454	400 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	POL4	P25615	582 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	MSP1	P28737	362 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	VPS17	P32913	551 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	MUP3	P38734	546 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	NAS2	P40555	220 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	PXA1	P41909	870 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	ZAP1	P47043	880 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	TAH11	P47112	604 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	PEF1	P53238	335 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	SNF12	P53628	566 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	RRN5	Q02983	363 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	PLB2	Q03674	706 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	VPS64	Q03944	604 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	SIZ1	Q04195	904 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	MMR1	Q06324	491 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YHI9	YHR029C	SGO1	Q08490	590 aa		4.05	□□□□□ -1.76

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