RNA–Protein interactions for RNA: YFR009W

GCN20, Transcript of Positive regulator of the Gcn2p kinase activity, yeast

Gene GCN20, Length 2,259 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GCN20	YFR009W	NBP2	Q12163	236 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	ATG34	Q12292	412 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	LDB17	Q12342	491 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	STB3	Q12427	513 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	YPR089W	O13585	888 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	ZIP1	P31111	875 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	AEP1	P32493	518 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	UBX7	P38349	436 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	ARN1	P38731	627 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	LAM1	P38851	1228 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	YGL108C	P53139	140 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	NHX1	Q04121	633 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	ARP9	Q05123	467 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	ATG26	Q06321	1198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	PSR1	Q07800	427 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	APC9	Q12107	265 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	NMT1	P14743	455 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	RGR1	P19263	1082 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	VPS34	P22543	875 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	PHO87	P25360	923 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	ATP7	P30902	174 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	BCK2	P33306	851 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	TKL2	P33315	681 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	HSP78	P33416	811 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	YHI9	P38765	294 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	YEL028W	P39989	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	ATM1	P40416	690 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	SKP2	P42843	763 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	PEX21	P50091	288 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	YTP1	P53584	459 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	SLM2	P53955	656 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	SPC2	Q04969	178 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	SEC10	Q06245	871 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	GGA1	Q06336	557 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	ENT4	Q07872	247 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	YOL019W	Q08157	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	DDC1	Q08949	612 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	GPM2	Q12008	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	ICL2	Q12031	575 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	GET4	Q12125	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	NHA1	Q99271	985 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	TYR1	P20049	452 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	SEC15	P22224	910 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	SAN1	P22470	610 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	BIO2	P32451	375 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	GDA1	P32621	518 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	AIM26	P32858	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	DUR3	P33413	735 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	MRPL7	P36519	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	YHL026C	P38740	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	TGL3	P40308	642 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	YJR061W	P40355	935 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	MAF1	P41910	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	STB4	P50104	949 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	INA17	Q02888	182 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	YMR155W	Q03795	547 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	YET2	Q04210	160 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	YDL121C	Q07541	149 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	YOR022C	Q12204	715 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	UBR2	Q07963	1872 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	CCP1	P00431	361 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	CSM1	P25651	190 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	DRE2	P36152	348 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	MNN1	P39106	762 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	ARH1	P48360	493 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	GCV2	P49095	1034 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	YNL011C	P53980	444 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GCN20	YFR009W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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