RNA–Protein interactions for RNA: YBL048W

RRT1, Transcript of Protein of unknown function, yeastyeast

Gene RRT1, Length 312 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRT1YBL048W HOS1Q12214 470 aa3.56□□□□□ -1.84
RRT1YBL048W PET309P32522 965 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RRT1YBL048W LNP1P38878 278 aa3.55□□□□□ -1.84
RRT1YBL048W DUG1P43616 481 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RRT1YBL048W FMP42Q04991 504 aa3.55□□□□□ -1.84
RRT1YBL048W CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RRT1YBL048W EAF5P39995 279 aa3.54□□□□□ -1.84
RRT1YBL048W LEA1Q08963 238 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RRT1YBL048W NUP145P49687 1317 aa3.53□□□□□ -1.84
RRT1YBL048W PRE2P30656 287 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RRT1YBL048W MNN2P38069 597 aa3.53□□□□□ -1.84
RRT1YBL048W SSP120P39931 234 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
RRT1YBL048W CAC2Q04199 468 aa3.53□□□□□ -1.84
RRT1YBL048W PDR8Q06149 701 aa3.53□□□□□ -1.84
RRT1YBL048W FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RRT1YBL048W ILV2P07342 687 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W MSS51P32335 436 aa3.52□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W OCT1P35999 772 aa3.52□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W RPF2P36160 344 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W ERC1P38767 581 aa3.52□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W SND1Q04007 877 aa3.52□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W ARP9Q05123 467 aa3.52□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W PIG1Q06216 648 aa3.52□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W THI3Q07471 609 aa3.52□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W YLR112WQ12130 139 aa3.52□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W RMP1Q12530 201 aa3.52□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W SEC1P30619 724 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W BZZ1P38822 633 aa3.51□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W DHH1P39517 506 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W VPS25P47142 202 aa3.51□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W YPR003CP53394 754 aa3.51□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W APL5Q08951 932 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W STL1P39932 569 aa3.5□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W ASG1P40467 964 aa3.5□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W IMP4P53941 290 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W YMR254CQ04838 102 aa3.5□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W POS5Q06892 414 aa3.5□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W EFM2P38347 419 aa3.49□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W YGR237CP50089 785 aa3.49□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W TRS31Q03337 283 aa3.49□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W IZH1Q03419 316 aa3.49□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W SMA2Q04658 369 aa3.49□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W CRF1Q04930 467 aa3.49□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W TRI1Q05024 226 aa3.49□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W ECI1Q05871 280 aa3.49□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W TAH18Q12181 623 aa3.49□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W ARB1P40024 610 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W NIT2P47016 307 aa3.48□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W CUL3P53202 744 aa3.48□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W ESBP6P53918 673 aa3.48□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W YBR255C-AQ3E776 120 aa3.48□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W VFA1P40080 203 aa3.47□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W NPA3P47122 385 aa3.47□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W UBP8P50102 471 aa3.47□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W PSP1P50896 841 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W YRB30P53107 440 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W YLR352WQ06479 807 aa3.47□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W MCH4Q08268 501 aa3.47□□□□□ -1.85
RRT1YBL048W PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W COX11P19516 300 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W POL31P46957 487 aa3.46□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W CRZ1P53968 678 aa3.46□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W SWF1Q04629 336 aa3.46□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W TIP41Q12199 356 aa3.46□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W DBP10Q12389 995 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W HNM1P19807 563 aa3.45□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W SIP1P32578 815 aa3.45□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W YJL070CP40361 888 aa3.45□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W YJR142WP47173 342 aa3.45□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W SPC105P53148 917 aa3.45□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W HOL1P53389 586 aa3.45□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W FRE3Q08905 711 aa3.45□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W SWC3P31376 625 aa3.44□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W HEM12P32347 362 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W LEU5P38702 357 aa3.44□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W ROK1P45818 564 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W SLD3P53135 668 aa3.44□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W CTT1P06115 562 aa3.43□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W PDE1P22434 369 aa3.43□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W LAC1P28496 418 aa3.43□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W HES1P35843 434 aa3.43□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W NMD2P38798 1089 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W FCP1Q03254 732 aa3.43□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W RSA1Q08932 381 aa3.43□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W YML002WP0CF17 737 aa3.42□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W EMP65P40085 556 aa3.42□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W PMS1P14242 873 aa3.41□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W ATG27P46989 271 aa3.41□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W IML2P47031 731 aa3.41□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W PUS4P48567 403 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W YGL081WP53156 320 aa3.41□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W AIM6Q07716 390 aa3.41□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W YBR298C-AQ8TGK4 73 aa3.41□□□□□ -1.86
RRT1YBL048W COX1P00401 534 aa3.4□□□□□ -1.87
RRT1YBL048W YCR006CP25350 157 aa3.4□□□□□ -1.87
RRT1YBL048W RPS7AP26786 190 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RRT1YBL048W PEX15Q08215 383 aa3.4□□□□□ -1.87
RRT1YBL048W PSF3Q12146 194 aa3.4□□□□□ -1.87
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