RNA–Protein interactions for RNA: Q0140

VAR1, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene VAR1, Length 1,197 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	Q0140	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
VAR1	Q0140	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
VAR1	Q0140	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
VAR1	Q0140	MSS51	P32335	436 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VAR1	Q0140	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
VAR1	Q0140	PCL6	P40038	420 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VAR1	Q0140	GSM1	P42950	618 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VAR1	Q0140	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
VAR1	Q0140	RMP1	Q12530	201 aa		3.8	□□□□□ -1.8
VAR1	Q0140	PTC6	P25646	442 aa		3.79	□□□□□ -1.8
VAR1	Q0140	EAF5	P39995	279 aa		3.79	□□□□□ -1.8
VAR1	Q0140	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
VAR1	Q0140	QRI7	P43122	407 aa		3.79	□□□□□ -1.8
VAR1	Q0140	YNR071C	P53757	342 aa		3.79	□□□□□ -1.8
VAR1	Q0140	FMP42	Q04991	504 aa		3.79	□□□□□ -1.8
VAR1	Q0140	DIN7	Q12086	430 aa		3.79	□□□□□ -1.8
VAR1	Q0140	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
VAR1	Q0140	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
VAR1	Q0140	MAD2	P40958	196 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VAR1	Q0140	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
VAR1	Q0140	YGR237C	P50089	785 aa		3.78	□□□□□ -1.8
VAR1	Q0140	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	PCA1	P38360	1216 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	VPS25	P47142	202 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	THI3	Q07471	609 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	BSC6	Q08280	497 aa		3.77	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	REV1	P12689	985 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	MNN2	P38069	597 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	VPS41	P38959	992 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	PDR8	Q06149	701 aa		3.76	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	OCT1	P35999	772 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	BZZ1	P38822	633 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	STL1	P39932	569 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	CRF1	Q04930	467 aa		3.75	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	CDC23	P16522	626 aa		3.74	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	SIP1	P32578	815 aa		3.74	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	ERC1	P38767	581 aa		3.74	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	CDC1	P40986	491 aa		3.74	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	ADD37	Q03233	198 aa		3.74	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	IZH1	Q03419	316 aa		3.74	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	YLR112W	Q12130	139 aa		3.74	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	VFA1	P40080	203 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	SPC105	P53148	917 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	YPR003C	P53394	754 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	TIP41	Q12199	356 aa		3.73	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	YJR142W	P47173	342 aa		3.72	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	UBP8	P50102	471 aa		3.72	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	HOL1	P53389	586 aa		3.72	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	TRS31	Q03337	283 aa		3.72	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	SND1	Q04007	877 aa		3.72	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	CAC2	Q04199	468 aa		3.72	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	ECI1	Q05871	280 aa		3.72	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	PIG1	Q06216	648 aa		3.72	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	POS5	Q06892	414 aa		3.72	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	TAH18	Q12181	623 aa		3.72	□□□□□ -1.81
VAR1	Q0140	SWC3	P31376	625 aa		3.71	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	ASG1	P40467	964 aa		3.71	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	NIT2	P47016	307 aa		3.71	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	ARP9	Q05123	467 aa		3.71	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	MCH4	Q08268	501 aa		3.71	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	CTT1	P06115	562 aa		3.7	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	SLD3	P53135	668 aa		3.7	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	APJ1	P53940	528 aa		3.7	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	CRZ1	P53968	678 aa		3.7	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	YMR254C	Q04838	102 aa		3.7	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	TRI1	Q05024	226 aa		3.7	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	NPA3	P47122	385 aa		3.69	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	ESBP6	P53918	673 aa		3.69	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		3.69	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	PDE1	P22434	369 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	EFM2	P38347	419 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	POL31	P46957	487 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	CUL3	P53202	744 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	SWF1	Q04629	336 aa		3.68	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	LAC1	P28496	418 aa		3.67	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	YLR352W	Q06479	807 aa		3.67	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	PSF3	Q12146	194 aa		3.67	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		3.67	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	HNM1	P19807	563 aa		3.66	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	EMP65	P40085	556 aa		3.66	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	FRE3	Q08905	711 aa		3.66	□□□□□ -1.82
VAR1	Q0140	YCR006C	P25350	157 aa		3.65	□□□□□ -1.83

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