RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hist1h2bhQ64478 126 aa14.85□□□□□ -0.03
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hist2h2bbQ64525 126 aa14.85□□□□□ -0.03
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hist1h2bcQ6ZWY9 126 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Chchd1Q9CQA6 118 aa14.85□□□□□ -0.03
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Atg101Q9D8Z6 218 aa14.85□□□□□ -0.03
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 EsdQ9R0P3 282 aa14.85□□□□□ -0.03
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ighv2-6A0A075B6A7 116 aa14.84□□□□□ -0.03
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rpl36-ps4A0A140T8U4 117 aa14.84□□□□□ -0.03
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm28044L7N1X0 119 aa14.84□□□□□ -0.03
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 S100a1P56565 94 aa14.84□□□□□ -0.03
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Psors1c2Q80ZC9 134 aa14.84□□□□□ -0.03
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mrps10Q80ZK0 160 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 RnasekQ8K3C0 98 aa14.84□□□□□ -0.03
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pdzd11Q9CZG9 140 aa14.84□□□□□ -0.03
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 U90926O08546 118 aa14.83□□□□□ -0.04
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 E130208F15RikQ3UPV3 143 aa14.83□□□□□ -0.04
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Defa35E9QLQ1 93 aa14.82□□□□□ -0.04
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm4861Q8C5A4 106 aa14.82□□□□□ -0.04
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ifitm1Q9D103 106 aa14.82□□□□□ -0.04
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tspan13Q9D8C2 204 aa14.82□□□□□ -0.04
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm2696A0A1W2P709 240 aa14.81□□□□□ -0.04
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pkd1O08852 4293 aa14.8□□□□□ -0.04
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ighv1-11A0A0A6YWI9 117 aa14.8□□□□□ -0.04
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tnfsf18Q7TS55 173 aa14.8□□□□□ -0.04
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tm2d2Q8R0I4 213 aa14.8□□□□□ -0.04
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm42420A0A0J9YUQ2 99 aa14.79□□□□□ -0.04
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Igkv3-9A0A140T8P4 119 aa14.79□□□□□ -0.04
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Insl3O09107 122 aa14.79□□□□□ -0.04
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 P03985 172 aa14.79□□□□□ -0.04
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PemtQ61907 199 aa14.79□□□□□ -0.04
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Stard4Q99JV5 224 aa14.79□□□□□ -0.04
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Prss29Q99MS4 279 aa14.79□□□□□ -0.04
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PolP10400 120 aa14.78□□□□□ -0.04
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rpl39P62892 51 aa14.78□□□□□ -0.04
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Plac8l1Q08EJ0 177 aa14.78□□□□□ -0.04
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rbx1P62878 108 aa14.77□□□□□ -0.05
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Odf3l2Q3TZ65 277 aa14.77□□□□□ -0.05
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fam241bQ9D882 120 aa14.77□□□□□ -0.05
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Q5BN45 167 aa14.76□□□□□ -0.05
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cox7a2lQ61387 111 aa14.76□□□□□ -0.05
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Malsu1Q9CWV0 228 aa14.76□□□□□ -0.05
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Atxn7l1Q9CZ05 146 aa14.76□□□□□ -0.05
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm45785A0A1B0GT05 94 aa14.75□□□□□ -0.05
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 OtorQ9JIE3 128 aa14.75□□□□□ -0.05
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Igkv3-1A0A075B5P1 119 aa14.74□□□□□ -0.05
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 A0A1Y7VMQ4 148 aa14.74□□□□□ -0.05
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Timm10bQ9WV96 100 aa14.74□□□□□ -0.05
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Stard9Q80TF6 4561 aa14.74□□□□□ -0.05
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Esp4A8R0T8 117 aa14.73□□□□□ -0.05
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Q3UNZ8 350 aa14.73□□□□□ -0.05
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Bsph1Q3UW26 133 aa14.73□□□□□ -0.05
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 HilpdaQ9JLS0 64 aa14.73□□□□□ -0.05
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp951A0A087WRH0 451 aa14.72□□□□□ -0.05
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 FcorP0DJI6 106 aa14.72□□□□□ -0.05
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 BC025920Q3US60 128 aa14.72□□□□□ -0.05
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dnah2P0C6F1 4456 aa14.71□□□□□ -0.06
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm13030A2APQ6 143 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cdc42se2Q8BGH7 84 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 SmagpQ99KC7 97 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Plpp2Q9DAX2 276 aa14.7□□□□□ -0.06
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Igll1P20764 209 aa14.69□□□□□ -0.06
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm9747Q810H1 104 aa14.69□□□□□ -0.06
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gng4P50153 75 aa14.68□□□□□ -0.06
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dnah9B1AR51 4484 aa14.68□□□□□ -0.06
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm21693J3QK27 380 aa14.67□□□□□ -0.06
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fam19a4Q7TPG5 135 aa14.67□□□□□ -0.06
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tm4sf20Q9CQY8 226 aa14.67□□□□□ -0.06
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 MobpQ9D2P8 170 aa14.66□□□□□ -0.06
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 EnhoQ8K1D8 76 aa14.65□□□□□ -0.06
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Higd1aQ9JLR9 95 aa14.65□□□□□ -0.06
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 SacsQ9JLC8 4582 aa14.64□□□□□ -0.07
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ighv2-6-8A0A0A6YWY9 116 aa14.63□□□□□ -0.07
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Trav3-3Q5R1C3 114 aa14.63□□□□□ -0.07
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Timm17aQ9Z0V8 171 aa14.63□□□□□ -0.07
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Igkv4-79A0A075B5L8 119 aa14.62□□□□□ -0.07
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Esp34G3UXG0 151 aa14.62□□□□□ -0.07
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PlnP61014 52 aa14.62□□□□□ -0.07
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm10842Q3U587 122 aa14.62□□□□□ -0.07
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cfap126Q6P8X9 189 aa14.62□□□□□ -0.07
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm16485Q8C4B7 115 aa14.62□□□□□ -0.07
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 RetnQ99P87 114 aa14.62□□□□□ -0.07
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm1968Q3T9I3 115 aa14.61□□□□□ -0.07
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 NpyP57774 97 aa14.6□□□□□ -0.07
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pla2g2eQ9QUL3 142 aa14.6□□□□□ -0.07
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Trav7-6A0A075B640 112 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Scgb1b11A0A087WQJ0 93 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ighv1-72P01751 139 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Q9DAQ5 155 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Bak1O08734 209 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ifitm10Q8BR26 201 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dync1h1Q9JHU4 4644 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ighv13-2A0A0A6YWN3 119 aa14.57□□□□□ -0.08
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Prh1P05142 261 aa14.57□□□□□ -0.08
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 SnrpeP62305 92 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cd33Q63994 403 aa14.57□□□□□ -0.08
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem223Q9CQE2 199 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hist3h2bbQ8CGP0 126 aa14.55□□□□□ -0.08
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tma7Q8K003 64 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hist3h2baQ9D2U9 126 aa14.55□□□□□ -0.08
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 4930546C10RikE9Q4Y3 121 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 130.9 ms