Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Z6

Atg101, Autophagy-related protein 101, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg101Q9D8Z6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atg101Q9D8Z6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atg101Q9D8Z6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg101Q9D8Z6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg101Q9D8Z6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg101Q9D8Z6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg101Q9D8Z6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Atg101Q9D8Z6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atg101Q9D8Z6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atg101Q9D8Z6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg101Q9D8Z6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg101Q9D8Z6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg101Q9D8Z6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg101Q9D8Z6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atg101Q9D8Z6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg101Q9D8Z6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg101Q9D8Z6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg101Q9D8Z6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg101Q9D8Z6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg101Q9D8Z6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg101Q9D8Z6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atg101Q9D8Z6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atg101Q9D8Z6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg101Q9D8Z6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg101Q9D8Z6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Atg101Q9D8Z6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Atg101Q9D8Z6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atg101Q9D8Z6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atg101Q9D8Z6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atg101Q9D8Z6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atg101Q9D8Z6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atg101Q9D8Z6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atg101Q9D8Z6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg101Q9D8Z6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg101Q9D8Z6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg101Q9D8Z6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg101Q9D8Z6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg101Q9D8Z6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg101Q9D8Z6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atg101Q9D8Z6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg101Q9D8Z6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg101Q9D8Z6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg101Q9D8Z6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Atg101Q9D8Z6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg101Q9D8Z6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atg101Q9D8Z6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg101Q9D8Z6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atg101Q9D8Z6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atg101Q9D8Z6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atg101Q9D8Z6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atg101Q9D8Z6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg101Q9D8Z6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg101Q9D8Z6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atg101Q9D8Z6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg101Q9D8Z6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atg101Q9D8Z6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atg101Q9D8Z6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg101Q9D8Z6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atg101Q9D8Z6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atg101Q9D8Z6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atg101Q9D8Z6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg101Q9D8Z6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atg101Q9D8Z6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg101Q9D8Z6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg101Q9D8Z6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atg101Q9D8Z6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg101Q9D8Z6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg101Q9D8Z6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atg101Q9D8Z6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Atg101Q9D8Z6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atg101Q9D8Z6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg101Q9D8Z6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg101Q9D8Z6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atg101Q9D8Z6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Atg101Q9D8Z6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Atg101Q9D8Z6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Atg101Q9D8Z6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg101Q9D8Z6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Atg101Q9D8Z6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atg101Q9D8Z6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg101Q9D8Z6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg101Q9D8Z6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atg101Q9D8Z6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atg101Q9D8Z6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atg101Q9D8Z6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg101Q9D8Z6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atg101Q9D8Z6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg101Q9D8Z6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg101Q9D8Z6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg101Q9D8Z6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atg101Q9D8Z6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg101Q9D8Z6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg101Q9D8Z6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg101Q9D8Z6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Atg101Q9D8Z6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg101Q9D8Z6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg101Q9D8Z6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg101Q9D8Z6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Atg101Q9D8Z6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Atg101Q9D8Z6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms